125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4183 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  44.92 
 
 		 885 aa  682    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 944 aa  1921    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.01 
 
 		 854 aa  606  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  39.88 
 
 		 868 aa  588  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  38.74 
 
 		 851 aa  566  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  39.47 
 
 		 853 aa  558  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  37.75 
 
 		 891 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  36.93 
 
 		 960 aa  525  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  35.97 
 
 		 950 aa  512  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  35.53 
 
 		 950 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 905 aa  476  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 905 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.07 
 
 		 904 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  34.3 
 
 		 840 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  33.83 
 
 		 822 aa  369  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  32.37 
 
 		 845 aa  356  1e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  31.06 
 
 		 883 aa  351  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 796 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  29.64 
 
 		 698 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.96 
 
 		 809 aa  186  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  31.53 
 
 		 1009 aa  170  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.97 
 
 		 1772 aa  167  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  27.23 
 
 		 725 aa  162  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.27 
 
 		 1650 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.87 
 
 		 3298 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  27.6 
 
 		 418 aa  154  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  31.6 
 
 		 553 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.33 
 
 		 3535 aa  152  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.6 
 
 		 3419 aa  151  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.64 
 
 		 957 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  29.81 
 
 		 447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.75 
 
 		 3299 aa  148  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.2 
 
 		 3537 aa  146  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.23 
 
 		 2637 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 949 aa  118  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 		 1060 aa  118  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  30.66 
 
 		 828 aa  111  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.03 
 
 		 991 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 916 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.04 
 
 		 2741 aa  102  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.45 
 
 		 2741 aa  100  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 1215 aa  91.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1162 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.21 
 
 		 1162 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1931  S-layer region-like  66.15 
 
 		 606 aa  85.1  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.575111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.2 
 
 		 919 aa  85.1  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.2 
 
 		 1328 aa  84  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  28.66 
 
 		 192 aa  82.4  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 854 aa  82  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  25.84 
 
 		 532 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  31.87 
 
 		 1039 aa  77  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  26.62 
 
 		 884 aa  77  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 729 aa  75.1  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  29.83 
 
 		 1051 aa  73.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  26.35 
 
 		 1266 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 851 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  38.14 
 
 		 717 aa  72.4  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 1025 aa  71.6  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 		 1409 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1036 aa  70.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.04 
 
 		 968 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  26.24 
 
 		 903 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1025 aa  67.4  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1054 aa  65.1  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 937 aa  65.1  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 928 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1051 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 846 aa  63.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  29.07 
 
 		 1246 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  26.09 
 
 		 893 aa  62  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  24.16 
 
 		 827 aa  61.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  24.88 
 
 		 874 aa  60.1  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  31.15 
 
 		 877 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  24.73 
 
 		 565 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.41 
 
 		 1186 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.6 
 
 		 1135 aa  57.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  21.55 
 
 		 934 aa  57  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 1365 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 1475 aa  56.6  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 		 1055 aa  55.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1077 aa  56.2  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  34.62 
 
 		 121 aa  56.2  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  24.63 
 
 		 909 aa  55.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  25.43 
 
 		 985 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  29.52 
 
 		 989 aa  55.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  31.58 
 
 		 937 aa  54.7  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6701  hypothetical protein  23.8 
 
 		 675 aa  54.7  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2310  diguanylate cyclase  26.85 
 
 		 718 aa  54.7  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1238 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  20.79 
 
 		 782 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1024 aa  52.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  20.86 
 
 		 1247 aa  52.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.53 
 
 		 1468 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  28.99 
 
 		 1013 aa  51.6  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 868 aa  51.2  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  20.64 
 
 		 1192 aa  51.2  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  25.51 
 
 		 1022 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  32.23 
 
 		 1241 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  30.14 
 
 		 1171 aa  50.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  22.17 
 
 		 994 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>