115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2488 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  43.97 
 
 
868 aa  699    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  41.78 
 
 
960 aa  662    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 
950 aa  1914    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45 
 
 
854 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  98.63 
 
 
950 aa  1892    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  41.28 
 
 
851 aa  623  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  40.25 
 
 
853 aa  619  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  40.21 
 
 
885 aa  605  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  40.2 
 
 
891 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  38.49 
 
 
905 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  38.18 
 
 
905 aa  557  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  35.97 
 
 
944 aa  529  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.6 
 
 
904 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  38.19 
 
 
840 aa  457  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  36.6 
 
 
845 aa  455  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 
822 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
883 aa  339  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  37.05 
 
 
796 aa  298  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  31.94 
 
 
698 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  33.47 
 
 
725 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.1 
 
 
3298 aa  199  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.83 
 
 
3535 aa  196  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.41 
 
 
3537 aa  196  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.83 
 
 
3419 aa  195  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.83 
 
 
1772 aa  194  6e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.99 
 
 
1009 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  36.36 
 
 
1650 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  32.71 
 
 
809 aa  186  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.42 
 
 
3299 aa  184  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  36.66 
 
 
447 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  29.35 
 
 
553 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  22.99 
 
 
957 aa  171  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 
949 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  34.05 
 
 
418 aa  157  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 
1060 aa  148  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  31.88 
 
 
828 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 
991 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.49 
 
 
2637 aa  131  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.54 
 
 
1328 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  30.54 
 
 
919 aa  100  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  29.76 
 
 
532 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.15 
 
 
1162 aa  98.6  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 
2741 aa  98.2  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
1162 aa  98.6  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  31.52 
 
 
192 aa  97.8  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 
729 aa  97.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.67 
 
 
2741 aa  95.9  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.34 
 
 
968 aa  88.6  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 
916 aa  87.8  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  29.62 
 
 
717 aa  85.1  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
854 aa  84.7  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
1215 aa  82.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  30.6 
 
 
893 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 
1054 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  27.72 
 
 
903 aa  75.5  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  40.38 
 
 
121 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  25.67 
 
 
884 aa  74.3  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  23.62 
 
 
1051 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
1365 aa  72.8  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 
1036 aa  72  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  27.57 
 
 
1051 aa  70.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  27.23 
 
 
565 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  23.26 
 
 
2145 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
851 aa  69.3  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 
1055 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  27.49 
 
 
1475 aa  65.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
937 aa  65.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  37 
 
 
923 aa  64.3  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 
1409 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  25.81 
 
 
909 aa  63.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 
928 aa  62.4  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.55 
 
 
1186 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  29.21 
 
 
1039 aa  61.6  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  26.07 
 
 
918 aa  61.6  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  25.77 
 
 
1025 aa  60.8  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  29.23 
 
 
989 aa  60.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
846 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
1025 aa  60.1  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  29.38 
 
 
1024 aa  57.8  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  28.83 
 
 
827 aa  57.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  26.55 
 
 
790 aa  56.6  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.4 
 
 
1135 aa  55.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  33 
 
 
1246 aa  55.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  25.11 
 
 
1077 aa  55.1  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.8 
 
 
1550 aa  55.1  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  27.27 
 
 
1228 aa  53.9  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.42 
 
 
609 aa  54.3  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  29.65 
 
 
934 aa  52  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
994 aa  51.6  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  32.06 
 
 
909 aa  51.6  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  24.4 
 
 
1266 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  22.04 
 
 
782 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  25.23 
 
 
874 aa  50.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  33.59 
 
 
811 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
1448 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
659 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  26.59 
 
 
496 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.38 
 
 
1238 aa  48.9  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  23.01 
 
 
799 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  28.86 
 
 
937 aa  48.5  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>