136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1301 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  100 
 
 		 989 aa  1945    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  32.82 
 
 		 934 aa  279  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  32.48 
 
 		 937 aa  253  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 1028 aa  174  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.85 
 
 		 1135 aa  170  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1024 aa  156  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 923 aa  152  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  32.96 
 
 		 877 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.28 
 
 		 1162 aa  118  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1025 aa  118  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 1162 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  23.29 
 
 		 1328 aa  112  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1025 aa  109  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  24.2 
 
 		 919 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  28.95 
 
 		 532 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1039 aa  101  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 		 1054 aa  100  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 854 aa  97.4  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 1036 aa  95.9  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1051 aa  94.7  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  28.67 
 
 		 893 aa  93.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.54 
 
 		 2741 aa  89.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 2741 aa  89.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 1215 aa  85.5  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1492  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1259 aa  85.1  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 1365 aa  83.2  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 937 aa  80.9  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 851 aa  76.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.73 
 
 		 1009 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  35.59 
 
 		 1475 aa  75.5  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.25 
 
 		 1424 aa  75.1  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 916 aa  75.1  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  31.55 
 
 		 903 aa  74.7  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1409 aa  74.7  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 729 aa  73.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.14 
 
 		 968 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  28.72 
 
 		 717 aa  72.8  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  30.3 
 
 		 853 aa  72.8  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  21.53 
 
 		 960 aa  72.4  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  29.7 
 
 		 840 aa  72  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  21.67 
 
 		 884 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  19.61 
 
 		 1060 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 851 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 868 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.38 
 
 		 991 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  28.02 
 
 		 845 aa  61.2  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  21.93 
 
 		 909 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 905 aa  60.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 905 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 796 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  29.23 
 
 		 950 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  29.23 
 
 		 950 aa  60.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.67 
 
 		 854 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 911 aa  59.7  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  26.78 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.56 
 
 		 1036 aa  58.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.99 
 
 		 1050 aa  57.4  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  27.09 
 
 		 1068 aa  57.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1077 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 822 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 1186 aa  55.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  30.54 
 
 		 918 aa  55.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  28.4 
 
 		 944 aa  55.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  25.66 
 
 		 827 aa  55.1  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 785 aa  55.1  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3448  hypothetical protein  26.07 
 
 		 847 aa  55.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.498192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.15 
 
 		 1507 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1051 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 883 aa  53.5  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  23.27 
 
 		 809 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  28.66 
 
 		 846 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.58 
 
 		 885 aa  53.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5235  predicted protein  29.68 
 
 		 236 aa  52.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.929624  normal  0.933998 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3127  helix-turn-helix domain protein  28.81 
 
 		 434 aa  52.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.641093  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  21.48 
 
 		 740 aa  52.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  25.42 
 
 		 801 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  28.93 
 
 		 891 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  22.5 
 
 		 1262 aa  52.4  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.16 
 
 		 828 aa  51.6  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  29.9 
 
 		 1468 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 751 aa  50.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  31.4 
 
 		 1142 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 1711 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  30.41 
 
 		 1147 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 868 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.34 
 
 		 787 aa  50.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  24.87 
 
 		 672 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.39 
 
 		 767 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  24.26 
 
 		 1128 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1171 aa  50.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1105 aa  50.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  25.59 
 
 		 1290 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 837 aa  49.7  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  30.43 
 
 		 713 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1448 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  19.17 
 
 		 1219 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 454 aa  49.3  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  30.51 
 
 		 680 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  25.39 
 
 		 1476 aa  48.9  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  28.65 
 
 		 959 aa  48.5  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>