241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0462 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  93.62 
 
 		 2741 aa  4952    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 2741 aa  5398    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 916 aa  223  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.97 
 
 		 1060 aa  209  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  25.72 
 
 		 1162 aa  206  6e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 1162 aa  205  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.92 
 
 		 828 aa  203  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 		 991 aa  187  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 		 729 aa  177  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.68 
 
 		 1025 aa  173  5e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  32.36 
 
 		 717 aa  166  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 		 923 aa  149  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  23.97 
 
 		 809 aa  142  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  33.79 
 
 		 532 aa  141  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.63 
 
 		 957 aa  140  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 949 aa  135  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.77 
 
 		 1266 aa  134  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 854 aa  132  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1711 aa  127  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  24.31 
 
 		 903 aa  125  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 937 aa  124  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 1365 aa  110  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3448  hypothetical protein  26.55 
 
 		 847 aa  110  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.498192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  24.79 
 
 		 1328 aa  109  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  28.12 
 
 		 1009 aa  109  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 868 aa  109  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  25.1 
 
 		 893 aa  109  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  24.68 
 
 		 891 aa  108  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 885 aa  106  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 		 968 aa  106  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1409 aa  104  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1215 aa  104  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  23.56 
 
 		 1219 aa  105  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 851 aa  103  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.84 
 
 		 854 aa  103  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  25.04 
 
 		 944 aa  102  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  27.92 
 
 		 919 aa  102  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 1621 aa  101  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4959  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 1544 aa  100  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  24.56 
 
 		 959 aa  100  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 868 aa  99.8  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 1779 aa  99.4  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  23.49 
 
 		 884 aa  99.4  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  21.79 
 
 		 1247 aa  98.2  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  33.5 
 
 		 874 aa  98.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 994 aa  96.7  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  25.55 
 
 		 840 aa  96.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  24.67 
 
 		 950 aa  95.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  24.67 
 
 		 950 aa  95.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  27.7 
 
 		 845 aa  95.1  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 		 846 aa  94  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  24.38 
 
 		 853 aa  93.2  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 905 aa  92.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 905 aa  92.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 1054 aa  92.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.98 
 
 		 1135 aa  90.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 796 aa  90.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 851 aa  89  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  29.54 
 
 		 989 aa  89.4  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  25.98 
 
 		 960 aa  88.2  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 822 aa  87.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.13 
 
 		 1186 aa  86.7  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1051 aa  84  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  27.97 
 
 		 565 aa  81.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  46.15 
 
 		 1507 aa  82  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  27.7 
 
 		 447 aa  80.9  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  30.28 
 
 		 827 aa  80.5  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  22.41 
 
 		 1247 aa  80.1  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.48 
 
 		 782 aa  79.7  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.6 
 
 		 1238 aa  79  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1276 aa  79.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 1526 aa  78.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  23.61 
 
 		 1007 aa  78.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.07 
 
 		 1650 aa  78.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  31.72 
 
 		 811 aa  77.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.05 
 
 		 904 aa  77.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  37.93 
 
 		 1475 aa  76.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  30 
 
 		 521 aa  76.3  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  32.86 
 
 		 873 aa  75.9  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 883 aa  75.5  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  20.11 
 
 		 909 aa  75.5  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  34 
 
 		 595 aa  75.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  27.95 
 
 		 418 aa  75.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 412 aa  74.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 1055 aa  75.5  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  29.21 
 
 		 937 aa  75.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  23.48 
 
 		 918 aa  74.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  27.56 
 
 		 905 aa  74.3  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  31.9 
 
 		 890 aa  74.3  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  31.07 
 
 		 848 aa  73.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  34.12 
 
 		 934 aa  72  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  28.57 
 
 		 883 aa  72.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.59 
 
 		 3299 aa  72.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  27.31 
 
 		 553 aa  71.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  27.41 
 
 		 897 aa  71.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.86 
 
 		 3298 aa  71.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 		 880 aa  71.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  30.19 
 
 		 890 aa  71.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  28 
 
 		 1147 aa  70.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.65 
 
 		 3535 aa  70.5  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>