109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5804 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
796 aa  1612    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  38 
 
 
868 aa  318  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  31.59 
 
 
883 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  35.28 
 
 
851 aa  306  9.000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  37.05 
 
 
950 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  37.17 
 
 
950 aa  299  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  35.61 
 
 
853 aa  298  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  33.59 
 
 
698 aa  297  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.71 
 
 
854 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 
885 aa  283  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  36.31 
 
 
891 aa  283  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  28.07 
 
 
944 aa  262  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
905 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 
905 aa  256  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  32.83 
 
 
960 aa  248  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  33.27 
 
 
822 aa  242  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  31.69 
 
 
840 aa  238  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  34.34 
 
 
725 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  30.13 
 
 
845 aa  228  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 
904 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  33.42 
 
 
447 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.15 
 
 
1650 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  31.85 
 
 
1009 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.46 
 
 
3537 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.98 
 
 
3535 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.98 
 
 
3419 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35.29 
 
 
3298 aa  143  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.67 
 
 
1772 aa  141  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  32.67 
 
 
553 aa  138  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 
949 aa  137  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.37 
 
 
3299 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  33.33 
 
 
809 aa  134  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.36 
 
 
957 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 
1060 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  32.16 
 
 
418 aa  121  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.09 
 
 
991 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.48 
 
 
2637 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.49 
 
 
828 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.85 
 
 
2741 aa  94  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  27.76 
 
 
884 aa  92  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  31.11 
 
 
532 aa  91.7  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.5 
 
 
2741 aa  90.5  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  37.58 
 
 
192 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
729 aa  84.3  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.72 
 
 
1328 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 
916 aa  80.9  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  24.43 
 
 
717 aa  80.9  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  27.53 
 
 
919 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
968 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  25.62 
 
 
903 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 
1025 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
854 aa  72  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
928 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
851 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
1409 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
1055 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  27.86 
 
 
1051 aa  67  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  29.12 
 
 
1025 aa  67.4  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 
1215 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  26.67 
 
 
909 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  27.46 
 
 
893 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1162 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
1162 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
868 aa  64.7  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
1054 aa  64.3  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3677  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 
1448 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114945  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  28.71 
 
 
937 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  27.8 
 
 
827 aa  61.6  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 
1365 aa  61.6  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
937 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  35.92 
 
 
121 aa  60.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  27.59 
 
 
989 aa  60.1  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 
1036 aa  59.7  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  26.12 
 
 
1475 aa  59.3  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.41 
 
 
1186 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
846 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.5 
 
 
1007 aa  54.7  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 
412 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  24.81 
 
 
1051 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.62 
 
 
1266 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  23.65 
 
 
985 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  25.86 
 
 
964 aa  51.6  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.1 
 
 
782 aa  51.6  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  27.42 
 
 
1039 aa  50.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
923 aa  49.3  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  22.25 
 
 
1024 aa  48.9  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 
994 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.52 
 
 
1056 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  34.18 
 
 
521 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6950  hypothetical protein  42.17 
 
 
909 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.568828  normal  0.658727 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  21.39 
 
 
1247 aa  48.5  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.9 
 
 
1022 aa  47.8  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  26.79 
 
 
1246 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  26.62 
 
 
1921 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  25 
 
 
1077 aa  46.6  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0047  hypothetical protein  26.73 
 
 
489 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
649 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  26.21 
 
 
874 aa  45.8  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  30.3 
 
 
1219 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  25.39 
 
 
1805 aa  45.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>