27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0047 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0047  hypothetical protein  100 
 
 
489 aa  1006    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  48.08 
 
 
979 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  30.73 
 
 
1020 aa  119  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3525  heterocyst differentiation protein  24.91 
 
 
835 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.857828  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  28.18 
 
 
1429 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0033  heterocyst differentiation protein HetF  25.46 
 
 
823 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  26.73 
 
 
806 aa  77  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.638928 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.58 
 
 
1238 aa  74.3  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  27.2 
 
 
1611 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
1714 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  26.21 
 
 
1914 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.45 
 
 
943 aa  57  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  27.41 
 
 
496 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 
1063 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
1313 aa  52.4  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1337  FHA domain-containing protein  27.71 
 
 
559 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  28.21 
 
 
848 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0620  hypothetical protein  35.65 
 
 
340 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0592031 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  26.15 
 
 
467 aa  47.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  24.9 
 
 
960 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5145  hypothetical protein  25.18 
 
 
1689 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0775613  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 
796 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
1285 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  22.57 
 
 
534 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2281  hypothetical protein  23.55 
 
 
440 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503347  normal  0.134184 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 
1526 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3255  FHA domain containing protein  25.32 
 
 
569 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>