153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0292 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  100 
 
 
903 aa  1852    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  37.16 
 
 
532 aa  168  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 
1162 aa  152  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.35 
 
 
1162 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.06 
 
 
2741 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.55 
 
 
2741 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.9 
 
 
717 aa  126  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
854 aa  126  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 
916 aa  122  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  26.93 
 
 
868 aa  119  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
729 aa  112  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 
809 aa  109  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 
1025 aa  105  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.27 
 
 
991 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
1215 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.8 
 
 
3535 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.8 
 
 
3419 aa  100  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.11 
 
 
3298 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  28.8 
 
 
418 aa  99  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  25.64 
 
 
923 aa  97.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.91 
 
 
919 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.03 
 
 
3537 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  27.97 
 
 
1009 aa  94  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  28.01 
 
 
957 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  29.23 
 
 
1328 aa  91.7  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
1711 aa  91.3  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  25.7 
 
 
447 aa  90.9  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.02 
 
 
3299 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  30.59 
 
 
827 aa  89  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.34 
 
 
1772 aa  88.2  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
1054 aa  86.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.8 
 
 
1650 aa  85.1  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 
883 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.19 
 
 
904 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
994 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  27.03 
 
 
893 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  32.86 
 
 
1024 aa  81.6  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  35.98 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  27.7 
 
 
853 aa  80.1  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 
968 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  37.1 
 
 
1475 aa  79  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 
949 aa  77.4  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  27.35 
 
 
553 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  39.19 
 
 
1077 aa  76.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.82 
 
 
2637 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  31.56 
 
 
565 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  27.72 
 
 
950 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
851 aa  75.5  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  24.22 
 
 
1365 aa  75.5  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  27.72 
 
 
950 aa  75.5  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  31.55 
 
 
989 aa  74.7  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 
1028 aa  74.7  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 
851 aa  74.7  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
868 aa  74.3  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  25.77 
 
 
884 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.58 
 
 
828 aa  73.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  21.49 
 
 
1247 aa  73.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  26.47 
 
 
891 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
846 aa  72.8  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 
796 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  29.72 
 
 
1051 aa  72.4  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 
1779 aa  72  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 
937 aa  71.2  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
1060 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
1409 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  24.53 
 
 
845 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  30.59 
 
 
371 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  38.26 
 
 
1507 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  24.09 
 
 
1007 aa  69.7  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  25.4 
 
 
643 aa  69.3  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 
822 aa  68.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
905 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 
905 aa  68.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.33 
 
 
854 aa  68.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  26.24 
 
 
944 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 
928 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
1055 aa  65.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  29.65 
 
 
909 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7301  WD-40 repeat-containing protein  23.77 
 
 
1247 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408957  hitchhiker  0.00671221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
1266 aa  64.3  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  24.35 
 
 
840 aa  64.3  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 
885 aa  62  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  29.12 
 
 
1268 aa  62.4  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  31.9 
 
 
1246 aa  62  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  35.51 
 
 
877 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  25.08 
 
 
960 aa  61.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  22.05 
 
 
1219 aa  61.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 
1476 aa  60.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  31.84 
 
 
873 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 
1036 aa  60.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.39 
 
 
1186 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.52 
 
 
1135 aa  59.7  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  27.42 
 
 
937 aa  58.9  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  27.11 
 
 
918 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.8 
 
 
2145 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  41.25 
 
 
121 aa  57.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
1276 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21160  hypothetical protein  24.94 
 
 
1171 aa  56.6  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.225843 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  30.25 
 
 
992 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.29 
 
 
782 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>