37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0200 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  100 
 
 
1268 aa  2610    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1925  hypothetical protein  38.01 
 
 
783 aa  313  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4676  hypothetical protein  30.22 
 
 
471 aa  149  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3056  PGAP1 family protein  28.44 
 
 
487 aa  138  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  30.06 
 
 
659 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  27.66 
 
 
1937 aa  81.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3055  hypothetical protein  24.58 
 
 
615 aa  74.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  26.97 
 
 
2159 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  26.47 
 
 
1805 aa  65.1  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  29.12 
 
 
903 aa  62  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.38 
 
 
943 aa  58.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4136  Tetratricopeptide domain protein  29.09 
 
 
1219 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
916 aa  53.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3192  hypothetical protein  24.68 
 
 
933 aa  52  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00191616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  27.16 
 
 
1051 aa  52  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  30.84 
 
 
1878 aa  50.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  29.14 
 
 
1104 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  23.46 
 
 
828 aa  50.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  26.74 
 
 
1142 aa  49.3  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 
1247 aa  48.5  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
1779 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  22.22 
 
 
1831 aa  48.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  25.14 
 
 
717 aa  47.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  29.24 
 
 
827 aa  47.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  24.1 
 
 
1921 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.9 
 
 
854 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.26 
 
 
532 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  23.63 
 
 
1460 aa  46.6  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  27.65 
 
 
1077 aa  46.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
905 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 
905 aa  45.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  25.74 
 
 
884 aa  45.8  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2159  hypothetical protein  23.82 
 
 
443 aa  45.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.722861  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
994 aa  45.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  23.31 
 
 
1611 aa  45.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  23.36 
 
 
467 aa  45.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  27.74 
 
 
1228 aa  45.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>