192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1214 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 1409 aa  684    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1365 aa  2782    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 937 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 1054 aa  386  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.43 
 
 		 1328 aa  296  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 1215 aa  276  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.34 
 
 		 1186 aa  235  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  26.48 
 
 		 919 aa  224  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 851 aa  187  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.6 
 
 		 968 aa  167  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  22.2 
 
 		 1507 aa  154  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.85 
 
 		 771 aa  147  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  26.9 
 
 		 799 aa  136  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  36.94 
 
 		 1475 aa  133  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.25 
 
 		 767 aa  128  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  26.73 
 
 		 1044 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  27.86 
 
 		 717 aa  125  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.72 
 
 		 787 aa  125  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 454 aa  125  7e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1039 aa  119  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.43 
 
 		 885 aa  115  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 843 aa  115  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  26.46 
 
 		 822 aa  115  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  30.45 
 
 		 532 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.94 
 
 		 725 aa  114  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.31 
 
 		 2741 aa  110  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.47 
 
 		 2741 aa  107  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.28 
 
 		 1424 aa  106  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 568 aa  105  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.09 
 
 		 568 aa  105  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.08 
 
 		 1162 aa  105  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 		 1162 aa  104  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  20.04 
 
 		 1262 aa  100  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 1025 aa  100  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  26.73 
 
 		 977 aa  96.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 729 aa  96.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  24.53 
 
 		 924 aa  95.9  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  28.22 
 
 		 672 aa  95.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  29.74 
 
 		 311 aa  94.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 751 aa  94  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 444 aa  92.8  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 481 aa  90.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.47 
 
 		 991 aa  88.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 854 aa  87.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  20.91 
 
 		 1105 aa  87  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 911 aa  86.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 916 aa  85.5  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.51 
 
 		 991 aa  84.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 1060 aa  84  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  24.38 
 
 		 680 aa  83.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  27.1 
 
 		 989 aa  83.2  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  24.27 
 
 		 1050 aa  81.6  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  24.65 
 
 		 362 aa  81.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  23.47 
 
 		 828 aa  81.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 923 aa  81.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  24.4 
 
 		 825 aa  80.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  28.14 
 
 		 937 aa  79  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  21.53 
 
 		 1550 aa  79  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 822 aa  78.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  30.26 
 
 		 212 aa  78.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 443 aa  77.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  25.35 
 
 		 732 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  23.19 
 
 		 1185 aa  77  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  33.85 
 
 		 1246 aa  76.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  32.57 
 
 		 1009 aa  75.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  22.75 
 
 		 1488 aa  75.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  24.22 
 
 		 903 aa  75.5  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23.16 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.05 
 
 		 1288 aa  74.3  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  25.11 
 
 		 893 aa  73.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  27.78 
 
 		 950 aa  73.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  26.98 
 
 		 950 aa  72.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  37.01 
 
 		 884 aa  72.8  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 190 aa  72  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  22.6 
 
 		 1131 aa  71.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  23.02 
 
 		 919 aa  71.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.16 
 
 		 1404 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.7 
 
 		 854 aa  70.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  27.2 
 
 		 840 aa  69.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  22.89 
 
 		 1128 aa  68.9  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  19.88 
 
 		 1290 aa  68.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  30.09 
 
 		 853 aa  67.8  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 		 851 aa  67.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  27.63 
 
 		 868 aa  67.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 928 aa  68.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 814 aa  68.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.76 
 
 		 2145 aa  67.4  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.71 
 
 		 904 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  27.04 
 
 		 845 aa  66.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.2 
 
 		 854 aa  65.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 669 aa  65.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  24.28 
 
 		 1088 aa  65.1  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  33.11 
 
 		 994 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  22.27 
 
 		 836 aa  64.7  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  36.46 
 
 		 891 aa  64.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  25.65 
 
 		 418 aa  65.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  21.99 
 
 		 694 aa  63.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 883 aa  63.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 162 aa  62.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>