More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46573 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  100 
 
 
694 aa  1433    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  46.16 
 
 
708 aa  578  1.0000000000000001e-163  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  45.37 
 
 
740 aa  558  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  37 
 
 
836 aa  429  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.85 
 
 
2145 aa  258  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.61 
 
 
1186 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
1215 aa  231  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.2 
 
 
1328 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 
787 aa  212  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  33.42 
 
 
454 aa  212  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.77 
 
 
725 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.98 
 
 
1424 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  23.82 
 
 
1040 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  27.86 
 
 
2327 aa  194  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.54 
 
 
771 aa  194  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.04 
 
 
767 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  24.2 
 
 
1507 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  31.27 
 
 
843 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.46 
 
 
1550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  31.71 
 
 
825 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
1105 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.76 
 
 
1288 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 
911 aa  176  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.76 
 
 
1404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 
924 aa  174  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  24.16 
 
 
1044 aa  174  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 
568 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
568 aa  174  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.09 
 
 
885 aa  173  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  23.48 
 
 
799 aa  172  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.43 
 
 
782 aa  171  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
444 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
649 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  25.78 
 
 
1039 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 
1060 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
443 aa  152  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 
1290 aa  151  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  29.06 
 
 
807 aa  150  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  29.64 
 
 
919 aa  147  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  29.39 
 
 
814 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  29.62 
 
 
493 aa  144  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  32.84 
 
 
311 aa  144  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  26.97 
 
 
1238 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  28.88 
 
 
732 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  29.9 
 
 
362 aa  140  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
1088 aa  137  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  26.15 
 
 
1106 aa  136  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  24.49 
 
 
822 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  30.34 
 
 
672 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  23.33 
 
 
828 aa  134  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  24.35 
 
 
1131 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  29.78 
 
 
919 aa  133  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 
949 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
284 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  26.24 
 
 
686 aa  130  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  32.3 
 
 
977 aa  130  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
751 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  28.6 
 
 
1914 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  22.16 
 
 
1050 aa  128  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.78 
 
 
991 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.93 
 
 
1228 aa  127  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 
785 aa  124  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.41 
 
 
854 aa  124  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.27 
 
 
991 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  25.54 
 
 
1068 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27 
 
 
667 aa  120  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 
1313 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  23.91 
 
 
957 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
857 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
639 aa  118  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  25.99 
 
 
1212 aa  117  6.9999999999999995e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 
1714 aa  117  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 
481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  20.78 
 
 
1128 aa  116  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43024  predicted protein  29.97 
 
 
576 aa  114  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000321984  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  18.7 
 
 
1262 aa  114  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  21.8 
 
 
1488 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
953 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
1261 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 
669 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44116  predicted protein  33.66 
 
 
757 aa  110  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
966 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  24.15 
 
 
1475 aa  110  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  25.09 
 
 
1429 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  31.98 
 
 
212 aa  108  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  21.54 
 
 
1054 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42451  predicted protein  26.29 
 
 
681 aa  107  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  26.8 
 
 
1028 aa  107  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 
776 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
190 aa  105  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  27.68 
 
 
680 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 
837 aa  105  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47465  predicted protein  25.37 
 
 
731 aa  103  9e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  21.18 
 
 
1185 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  23.51 
 
 
1435 aa  99.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.2 
 
 
1009 aa  99.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
1101 aa  97.8  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49102  predicted protein  27.21 
 
 
1731 aa  97.4  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.14 
 
 
828 aa  94.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
412 aa  91.3  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>