197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43024 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_43024  predicted protein  100 
 
 
576 aa  1190    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000321984  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  28.84 
 
 
740 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  29.97 
 
 
694 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  25.52 
 
 
2327 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.25 
 
 
1328 aa  109  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.07 
 
 
1040 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  25.33 
 
 
836 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  26.51 
 
 
807 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  27.38 
 
 
825 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  24.94 
 
 
708 aa  106  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
454 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
568 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.34 
 
 
568 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.13 
 
 
2145 aa  99  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  24.43 
 
 
1238 aa  98.2  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.57 
 
 
1186 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.22 
 
 
782 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  25.68 
 
 
1288 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  23.08 
 
 
822 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.76 
 
 
767 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
1215 aa  91.3  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  25.84 
 
 
493 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  23.36 
 
 
799 aa  90.1  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
843 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.2 
 
 
1228 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  26.79 
 
 
672 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 
857 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  23.89 
 
 
1131 aa  85.9  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.24 
 
 
1424 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 
481 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 
787 aa  84.7  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.22 
 
 
667 aa  84.7  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  22.31 
 
 
1550 aa  84  0.000000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.08 
 
 
854 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
924 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  21.51 
 
 
1507 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.1 
 
 
1404 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.12 
 
 
732 aa  80.5  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  24.83 
 
 
1106 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
771 aa  80.1  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  27.57 
 
 
919 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 
751 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
1060 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  24.64 
 
 
1212 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  23.68 
 
 
725 aa  77.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.59 
 
 
885 aa  77.4  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  22.62 
 
 
1044 aa  77  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 
1105 aa  77  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  29.7 
 
 
362 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25.38 
 
 
957 aa  74.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
1261 aa  74.3  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  30.18 
 
 
686 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.76 
 
 
919 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49102  predicted protein  28.44 
 
 
1731 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.56 
 
 
1039 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 
814 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  24.3 
 
 
1290 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 
911 aa  71.6  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  24.08 
 
 
977 aa  71.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
966 aa  71.2  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
949 aa  70.5  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44116  predicted protein  25 
 
 
757 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  23.08 
 
 
1068 aa  70.1  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 
1088 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
1526 aa  67.4  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  25.24 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 
639 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 
669 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 
953 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 
284 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  24.02 
 
 
1435 aa  65.1  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  22.93 
 
 
1475 aa  64.7  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.67 
 
 
991 aa  64.3  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  24.58 
 
 
680 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  22.49 
 
 
1050 aa  63.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 
1028 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48471  predicted protein  21.54 
 
 
495 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00174392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
991 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.14 
 
 
1036 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48337  predicted protein  28.43 
 
 
678 aa  62  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.13 
 
 
828 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  24.47 
 
 
2413 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  21.43 
 
 
1056 aa  60.8  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 
837 aa  60.1  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 
190 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 
785 aa  59.3  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
854 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47465  predicted protein  24.82 
 
 
731 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1936  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 
1911 aa  58.2  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.261102  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  24.23 
 
 
577 aa  57.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42809  predicted protein  27.44 
 
 
323 aa  57.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  21.11 
 
 
828 aa  57.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  20.1 
 
 
1180 aa  57.4  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.4 
 
 
1009 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 
649 aa  57  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 
1054 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  18.65 
 
 
725 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  22.39 
 
 
1488 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>