215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47465 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47465  predicted protein  100 
 
 
731 aa  1517    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.92 
 
 
2145 aa  151  4e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.58 
 
 
1186 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.34 
 
 
825 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  25.4 
 
 
1328 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  23.82 
 
 
454 aa  118  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 
1215 aa  117  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  23.74 
 
 
1040 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  24.18 
 
 
2327 aa  114  8.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  21.38 
 
 
1404 aa  114  9e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
843 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.15 
 
 
767 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 
1105 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.33 
 
 
1039 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  24.19 
 
 
708 aa  108  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  22.69 
 
 
1550 aa  107  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  25.37 
 
 
694 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.09 
 
 
568 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
568 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 
771 aa  102  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.63 
 
 
1424 aa  101  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 
949 aa  96.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  26.65 
 
 
911 aa  97.1  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.67 
 
 
782 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  24.62 
 
 
828 aa  94.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 
857 aa  94.7  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  23.4 
 
 
740 aa  94  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
924 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  24.19 
 
 
919 aa  92.4  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.1 
 
 
787 aa  91.3  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 
1088 aa  91.3  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
751 aa  90.9  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  23.84 
 
 
836 aa  89.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.16 
 
 
885 aa  89  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  22.76 
 
 
1068 aa  88.6  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  25.1 
 
 
672 aa  88.6  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  24.94 
 
 
919 aa  87.4  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
284 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  21.67 
 
 
1185 aa  85.5  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  25 
 
 
680 aa  84  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.86 
 
 
1238 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  23.25 
 
 
1228 aa  83.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  20.32 
 
 
1507 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  27.23 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  21.31 
 
 
725 aa  82.4  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  23.83 
 
 
807 aa  80.9  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  22.48 
 
 
1290 aa  80.9  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  20.7 
 
 
1288 aa  80.5  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
814 aa  80.1  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 
837 aa  78.6  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
1313 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.07 
 
 
732 aa  77.8  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 
1060 aa  77.4  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 
481 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  24.03 
 
 
822 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  21.49 
 
 
799 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  19.63 
 
 
1044 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.75 
 
 
828 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 
1028 aa  74.7  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  23.04 
 
 
1429 aa  74.7  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  19.02 
 
 
1131 aa  74.3  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  21.45 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  20.79 
 
 
1475 aa  74.3  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  20 
 
 
1262 aa  73.6  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  25.21 
 
 
1056 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  20.45 
 
 
1488 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  22 
 
 
1128 aa  73.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 
991 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  21.52 
 
 
953 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.2 
 
 
1266 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 
785 aa  73.2  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  21.73 
 
 
1106 aa  72.8  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  22.8 
 
 
977 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  21.12 
 
 
1283 aa  71.6  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  21.45 
 
 
1212 aa  72  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.46 
 
 
991 aa  71.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 
649 aa  70.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  19.43 
 
 
1050 aa  70.1  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.3 
 
 
841 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  22.54 
 
 
966 aa  68.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 
1261 aa  67.4  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  22.43 
 
 
801 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  26.43 
 
 
1101 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
343 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  21.32 
 
 
362 aa  64.3  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  27.01 
 
 
212 aa  63.9  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.11 
 
 
1036 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  22.39 
 
 
1523 aa  63.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49102  predicted protein  27.61 
 
 
1731 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.175517  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  19.75 
 
 
686 aa  62.4  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.91 
 
 
852 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  22.28 
 
 
1435 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44116  predicted protein  22.83 
 
 
757 aa  62  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 
412 aa  60.8  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.57 
 
 
809 aa  60.8  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  23.28 
 
 
1136 aa  60.8  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  19.8 
 
 
1054 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>