216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1566 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
669 aa  1370    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.83 
 
 
667 aa  362  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  40.8 
 
 
454 aa  221  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.16 
 
 
771 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.76 
 
 
787 aa  205  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.45 
 
 
885 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  35.89 
 
 
1328 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  36.13 
 
 
911 aa  192  1e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  36.8 
 
 
1039 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.07 
 
 
1424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 
1215 aa  185  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.62 
 
 
767 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 
444 aa  178  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  34.28 
 
 
568 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.28 
 
 
568 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  35.93 
 
 
362 aa  170  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  32.2 
 
 
825 aa  170  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  31.02 
 
 
1507 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  29.89 
 
 
725 aa  167  5.9999999999999996e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.07 
 
 
991 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
1105 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  33.24 
 
 
924 aa  165  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
751 aa  163  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  41.63 
 
 
311 aa  163  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 
1186 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
443 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 
843 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  29.97 
 
 
1044 aa  147  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  32.73 
 
 
919 aa  146  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  42.21 
 
 
212 aa  144  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  30.93 
 
 
493 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.48 
 
 
2145 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  30.29 
 
 
672 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 
284 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  28.8 
 
 
799 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
785 aa  136  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  30.84 
 
 
822 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 
1288 aa  132  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  26.3 
 
 
740 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  39.44 
 
 
190 aa  127  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 
953 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  30.1 
 
 
919 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  32.35 
 
 
680 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  31.8 
 
 
977 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
481 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
814 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  29.39 
 
 
1131 aa  121  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.63 
 
 
1550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  28 
 
 
1290 aa  118  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
949 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  21.98 
 
 
1404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  24.65 
 
 
1488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  28.36 
 
 
732 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  26.29 
 
 
708 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  23.03 
 
 
694 aa  110  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
966 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  21.73 
 
 
1262 aa  107  7e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  23.59 
 
 
1185 aa  106  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  26.42 
 
 
1040 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  23.16 
 
 
1128 aa  102  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 
937 aa  100  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.5 
 
 
1036 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  22.28 
 
 
1050 aa  99.8  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  25.23 
 
 
1056 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
1028 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 
162 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  27.79 
 
 
686 aa  98.2  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  25.49 
 
 
1475 aa  97.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  25.08 
 
 
1212 aa  97.1  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
1088 aa  95.5  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
1313 aa  95.1  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 
1054 aa  94.7  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.56 
 
 
1228 aa  94  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
1101 aa  91.3  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.5 
 
 
828 aa  90.5  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  34 
 
 
469 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 
851 aa  88.6  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.07 
 
 
968 aa  87.8  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 
857 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  27.66 
 
 
2413 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  27.06 
 
 
1106 aa  82.8  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.68 
 
 
854 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.38 
 
 
782 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 
1283 aa  79.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  24.93 
 
 
2327 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5157  hypothetical protein  34.87 
 
 
178 aa  79.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208303  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
1415 aa  79  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.31 
 
 
1238 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  30.43 
 
 
801 aa  77.4  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1060  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 
450 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  25.52 
 
 
776 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 
1060 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  22.44 
 
 
836 aa  74.3  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  26.58 
 
 
1479 aa  73.9  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
1063 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 
900 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  24.85 
 
 
807 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5235  predicted protein  26.52 
 
 
236 aa  72.8  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.929624  normal  0.933998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.24 
 
 
1266 aa  70.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  26.03 
 
 
1435 aa  70.9  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>