More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2765 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
751 aa  1542    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  36.77 
 
 
825 aa  473  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.19 
 
 
991 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  59.39 
 
 
454 aa  342  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  62.5 
 
 
1424 aa  320  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  57.2 
 
 
568 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  57.2 
 
 
568 aa  316  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  29.18 
 
 
919 aa  310  8e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  54.24 
 
 
924 aa  307  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  49.3 
 
 
911 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  48.02 
 
 
1328 aa  291  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.43 
 
 
771 aa  287  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.16 
 
 
767 aa  286  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  54.98 
 
 
284 aa  280  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  52.59 
 
 
1215 aa  278  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  53.14 
 
 
444 aa  275  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  46.2 
 
 
1039 aa  272  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  48.72 
 
 
1105 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  52.22 
 
 
311 aa  270  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  51.67 
 
 
672 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  52.31 
 
 
843 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  50.35 
 
 
362 aa  263  1e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  50.54 
 
 
919 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.31 
 
 
1186 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.86 
 
 
885 aa  258  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.15 
 
 
787 aa  257  5e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  47.78 
 
 
725 aa  257  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  59.07 
 
 
785 aa  256  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  48.88 
 
 
1507 aa  256  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  46.44 
 
 
1288 aa  245  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  51.95 
 
 
680 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  50.58 
 
 
977 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  47.1 
 
 
814 aa  236  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  49.59 
 
 
481 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  57.36 
 
 
212 aa  231  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  44.44 
 
 
1044 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  42.71 
 
 
1131 aa  224  4e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  43.66 
 
 
799 aa  207  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  55.62 
 
 
190 aa  201  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  41.83 
 
 
953 aa  200  7e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  40.31 
 
 
949 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  35.2 
 
 
1050 aa  197  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  41.4 
 
 
493 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  35.06 
 
 
1488 aa  191  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  36.33 
 
 
1262 aa  190  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  40.08 
 
 
1128 aa  189  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  39.36 
 
 
822 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  39.51 
 
 
443 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  35.91 
 
 
828 aa  183  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  44.4 
 
 
801 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  34.98 
 
 
1185 aa  172  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  37.16 
 
 
1028 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  35.09 
 
 
669 aa  164  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  33.74 
 
 
1290 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  26.7 
 
 
1125 aa  161  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  32.86 
 
 
1068 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  34.03 
 
 
732 aa  158  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  37.75 
 
 
1056 aa  158  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 
776 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.83 
 
 
667 aa  154  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  37.35 
 
 
1475 aa  153  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 
469 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 
837 aa  151  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  34.29 
 
 
2145 aa  150  9e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  41.23 
 
 
1228 aa  147  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  33.21 
 
 
1040 aa  145  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  33.05 
 
 
1550 aa  145  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 
304 aa  143  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  35.71 
 
 
963 aa  143  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  34.2 
 
 
577 aa  140  6e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 
966 aa  140  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
1088 aa  140  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  46.75 
 
 
162 aa  139  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  29.37 
 
 
1404 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 
1283 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0785  aminoglycoside phosphotransferase  27.74 
 
 
1160 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  47.16 
 
 
1036 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  30.16 
 
 
1106 aa  130  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  27.27 
 
 
694 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  33.47 
 
 
1212 aa  128  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.16 
 
 
968 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5157  hypothetical protein  41.94 
 
 
178 aa  127  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208303  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
857 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 
937 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  36.09 
 
 
2413 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 
1313 aa  119  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  27.1 
 
 
740 aa  117  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  28.73 
 
 
1054 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
851 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  31.87 
 
 
686 aa  115  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.92 
 
 
854 aa  115  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 
1101 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  34.56 
 
 
702 aa  114  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277202 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  32.53 
 
 
1136 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 
1146 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  31.2 
 
 
1324 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  29.17 
 
 
713 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3313  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
272 aa  111  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000795793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  29.6 
 
 
782 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  29.36 
 
 
708 aa  108  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>