More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0641 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 966 aa  1903    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  37.11 
 
 		 1105 aa  416  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  37.43 
 
 		 924 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.41 
 
 		 1424 aa  362  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 857 aa  357  5e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  34.53 
 
 		 953 aa  357  7.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 		 814 aa  312  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  39.52 
 
 		 640 aa  256  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  38.07 
 
 		 652 aa  251  7e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 671 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.41 
 
 		 1039 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1404 aa  208  4e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  24.04 
 
 		 1550 aa  207  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 911 aa  204  7e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.63 
 
 		 1186 aa  204  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  45.16 
 
 		 392 aa  203  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.55 
 
 		 767 aa  197  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.77 
 
 		 828 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 454 aa  185  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.63 
 
 		 787 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 843 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.81 
 
 		 1328 aa  177  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 776 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24.4 
 
 		 1288 aa  172  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.8 
 
 		 2145 aa  172  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  27.28 
 
 		 1088 aa  171  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 1215 aa  160  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.52 
 
 		 771 aa  160  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 949 aa  159  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.79 
 
 		 885 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  23.35 
 
 		 1050 aa  157  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  31.1 
 
 		 1068 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 444 aa  150  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 785 aa  148  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  29.38 
 
 		 1228 aa  148  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.32 
 
 		 568 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  31.32 
 
 		 568 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 		 1290 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  30.39 
 
 		 1040 aa  146  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  30.72 
 
 		 1131 aa  144  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  25.57 
 
 		 672 aa  144  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  38.17 
 
 		 751 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  29.59 
 
 		 934 aa  143  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  28.73 
 
 		 799 aa  142  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  27.45 
 
 		 825 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 284 aa  142  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.82 
 
 		 1507 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  28.62 
 
 		 838 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1383 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  25.8 
 
 		 680 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  21.56 
 
 		 1262 aa  133  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  27.81 
 
 		 1056 aa  132  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  21.83 
 
 		 1185 aa  131  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  27.48 
 
 		 899 aa  132  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  27.59 
 
 		 713 aa  131  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  24.66 
 
 		 822 aa  131  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  26.63 
 
 		 1324 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  33.45 
 
 		 362 aa  128  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.28 
 
 		 991 aa  127  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  34.48 
 
 		 1106 aa  127  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  30.5 
 
 		 481 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.93 
 
 		 725 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  29.18 
 
 		 897 aa  125  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 443 aa  124  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  27.85 
 
 		 992 aa  124  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 667 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  30.23 
 
 		 919 aa  122  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  24.26 
 
 		 1500 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  25.68 
 
 		 845 aa  122  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1212 aa  121  6e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  26.24 
 
 		 1044 aa  121  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.82 
 
 		 694 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  24.37 
 
 		 740 aa  119  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  25.81 
 
 		 493 aa  118  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 669 aa  117  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  26.22 
 
 		 686 aa  117  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  28.55 
 
 		 900 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  34.8 
 
 		 801 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  26.01 
 
 		 708 aa  114  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  32.7 
 
 		 311 aa  114  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  27.54 
 
 		 1309 aa  114  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1313 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  30.08 
 
 		 675 aa  112  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  23.27 
 
 		 977 aa  112  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  26.39 
 
 		 843 aa  111  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 837 aa  109  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  27.81 
 
 		 1000 aa  108  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  25.38 
 
 		 1314 aa  108  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 1101 aa  107  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  24.15 
 
 		 849 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  29.45 
 
 		 829 aa  105  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  26.52 
 
 		 971 aa  105  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  25.93 
 
 		 919 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  34.76 
 
 		 1028 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 		 1125 aa  103  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.74 
 
 		 732 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  25.41 
 
 		 1475 aa  103  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 937 aa  102  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  28.54 
 
 		 1429 aa  101  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  24.16 
 
 		 1488 aa  101  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>