More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2118 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1028 aa  1968    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  45.05 
 
 		 924 aa  251  6e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  31.52 
 
 		 937 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  39.14 
 
 		 1328 aa  238  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  38.06 
 
 		 1215 aa  233  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.53 
 
 		 1424 aa  232  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.23 
 
 		 1186 aa  230  9e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  39.4 
 
 		 1105 aa  227  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  38.58 
 
 		 454 aa  218  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  43.48 
 
 		 444 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  33.89 
 
 		 1507 aa  210  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 		 911 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  30.71 
 
 		 934 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.42 
 
 		 767 aa  194  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.43 
 
 		 787 aa  192  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.46 
 
 		 771 aa  191  4e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  29.49 
 
 		 989 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.34 
 
 		 885 aa  188  5e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  38.21 
 
 		 568 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.21 
 
 		 568 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  33.57 
 
 		 725 aa  183  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.79 
 
 		 1135 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  46.18 
 
 		 284 aa  174  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  31.57 
 
 		 1039 aa  172  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 		 1288 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  35.8 
 
 		 919 aa  164  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  36.86 
 
 		 751 aa  164  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1024 aa  162  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  33.69 
 
 		 953 aa  157  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  34.31 
 
 		 825 aa  155  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  30.81 
 
 		 1044 aa  154  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  34.68 
 
 		 1290 aa  153  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 		 1050 aa  152  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  30.38 
 
 		 799 aa  149  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  33.54 
 
 		 843 aa  149  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.05 
 
 		 991 aa  148  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 814 aa  145  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  38.05 
 
 		 672 aa  144  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.47 
 
 		 2145 aa  142  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 		 785 aa  135  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  27.53 
 
 		 822 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  34.47 
 
 		 362 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 481 aa  132  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 949 aa  132  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  29.83 
 
 		 1040 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  32.63 
 
 		 977 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.8 
 
 		 1550 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  34.88 
 
 		 680 aa  129  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  28.88 
 
 		 1128 aa  128  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  29.41 
 
 		 877 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 		 1025 aa  126  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  39.3 
 
 		 212 aa  125  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  29.61 
 
 		 1131 aa  125  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  25.37 
 
 		 1185 aa  125  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  34.47 
 
 		 311 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  25.24 
 
 		 1262 aa  120  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1068 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  26.09 
 
 		 1488 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  28.91 
 
 		 919 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  27.2 
 
 		 493 aa  115  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  28.23 
 
 		 732 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  27.49 
 
 		 1125 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  41.07 
 
 		 190 aa  112  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  28.7 
 
 		 828 aa  111  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  33.77 
 
 		 963 aa  107  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.8 
 
 		 740 aa  107  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49686  predicted protein  29.76 
 
 		 686 aa  107  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  29.64 
 
 		 1106 aa  106  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 443 aa  107  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.8 
 
 		 694 aa  106  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1036 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 837 aa  105  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  23.06 
 
 		 923 aa  105  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 776 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 1088 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1025 aa  100  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 669 aa  99.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 469 aa  99.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 		 1056 aa  97.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 		 667 aa  94.7  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  22.04 
 
 		 1009 aa  94.7  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.89 
 
 		 968 aa  94.7  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 966 aa  94.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 857 aa  93.2  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1212 aa  93.2  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  31.7 
 
 		 304 aa  92  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 878 aa  92  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.06 
 
 		 810 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  26.69 
 
 		 532 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5157  hypothetical protein  37.01 
 
 		 178 aa  89  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208303  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  25.28 
 
 		 708 aa  88.6  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  28.84 
 
 		 893 aa  88.6  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.93 
 
 		 841 aa  88.2  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.66 
 
 		 854 aa  88.2  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1404 aa  87.8  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1283 aa  87  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  30.29 
 
 		 1475 aa  85.5  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  23.29 
 
 		 2327 aa  84.7  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  30.51 
 
 		 577 aa  84  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1051 aa  82.8  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>