78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3192 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1036 aa  2091    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  45.46 
 
 		 1025 aa  786    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  45.31 
 
 		 1051 aa  800    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  50.49 
 
 		 1039 aa  939    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1024 aa  144  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  40.49 
 
 		 916 aa  99.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 		 1162 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.36 
 
 		 1162 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1028 aa  97.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  30.85 
 
 		 989 aa  95.9  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  31.25 
 
 		 937 aa  95.9  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  37.65 
 
 		 729 aa  85.5  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.77 
 
 		 1009 aa  84.7  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 868 aa  82.4  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.99 
 
 		 1135 aa  82  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 		 968 aa  81.6  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  34.52 
 
 		 934 aa  80.9  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.32 
 
 		 854 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  22.62 
 
 		 854 aa  78.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 851 aa  74.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  29.52 
 
 		 809 aa  73.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  27.81 
 
 		 853 aa  72.8  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  29.19 
 
 		 950 aa  72  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  29.19 
 
 		 950 aa  71.6  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1246 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  27.96 
 
 		 944 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  33.76 
 
 		 532 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  31.65 
 
 		 717 aa  70.1  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 904 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 905 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 905 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  38.89 
 
 		 1475 aa  69.7  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  34.59 
 
 		 893 aa  68.9  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 923 aa  68.9  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  30.11 
 
 		 957 aa  68.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.12 
 
 		 2741 aa  68.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.92 
 
 		 2741 aa  66.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  23.19 
 
 		 891 aa  64.7  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 822 aa  63.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 846 aa  62.4  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 937 aa  62  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  28.06 
 
 		 840 aa  61.2  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  30.46 
 
 		 903 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1409 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25.78 
 
 		 1650 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 		 1054 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  24.66 
 
 		 960 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.17 
 
 		 991 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  28.09 
 
 		 959 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  33.71 
 
 		 919 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 796 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1060 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  27.93 
 
 		 192 aa  58.9  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 883 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  33.14 
 
 		 1328 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  27.24 
 
 		 877 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 1215 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 885 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1365 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  26.2 
 
 		 845 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  22.33 
 
 		 884 aa  52.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  27.69 
 
 		 827 aa  52.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  28.16 
 
 		 828 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  25.27 
 
 		 725 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.88 
 
 		 3299 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.39 
 
 		 3298 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.39 
 
 		 3537 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.39 
 
 		 3535 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.39 
 
 		 3419 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 		 1055 aa  48.9  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 874 aa  48.9  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 851 aa  48.5  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  29.92 
 
 		 121 aa  48.5  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  27.84 
 
 		 918 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 928 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  26.6 
 
 		 2637 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  21.47 
 
 		 949 aa  45.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.59 
 
 		 1186 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>