80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5642 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 725 aa  1469    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  35.52 
 
 		 698 aa  336  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  34.34 
 
 		 796 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 851 aa  217  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.53 
 
 		 854 aa  214  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  30.36 
 
 		 853 aa  206  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  33.48 
 
 		 950 aa  200  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  33.26 
 
 		 950 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 868 aa  193  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  30.11 
 
 		 845 aa  193  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 		 883 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  30 
 
 		 891 aa  180  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  27.45 
 
 		 840 aa  170  8e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.54 
 
 		 904 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 905 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  27.23 
 
 		 944 aa  162  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 905 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  26.02 
 
 		 960 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 822 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 885 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1060 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.97 
 
 		 3298 aa  118  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  31.91 
 
 		 418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  27.35 
 
 		 828 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.34 
 
 		 1009 aa  110  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  24.54 
 
 		 447 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  30.87 
 
 		 1650 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.11 
 
 		 991 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  28.52 
 
 		 553 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.24 
 
 		 3537 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.94 
 
 		 3419 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.94 
 
 		 3535 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 		 949 aa  100  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.29 
 
 		 3299 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.28 
 
 		 809 aa  98.6  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.21 
 
 		 1772 aa  95.5  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  27.27 
 
 		 532 aa  88.2  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.59 
 
 		 957 aa  87.8  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  26.85 
 
 		 717 aa  76.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 916 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 854 aa  72.8  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  23.47 
 
 		 1055 aa  70.5  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 1215 aa  68.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  24.04 
 
 		 884 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  22.98 
 
 		 2637 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  35.16 
 
 		 937 aa  65.1  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  23.51 
 
 		 909 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  25.24 
 
 		 893 aa  64.3  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.24 
 
 		 968 aa  62.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.47 
 
 		 1328 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 851 aa  61.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.9 
 
 		 919 aa  60.8  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 		 1054 aa  60.1  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 		 1162 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 1162 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1238 aa  58.2  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 1025 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  27.33 
 
 		 192 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  29.28 
 
 		 1025 aa  53.9  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 928 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  31.63 
 
 		 923 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1036 aa  52  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  23.57 
 
 		 903 aa  51.2  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1192 aa  50.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1039 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  37.8 
 
 		 565 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1051 aa  49.7  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1365 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  23.94 
 
 		 827 aa  49.3  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 2741 aa  48.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 1409 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1711 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1147 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  31.91 
 
 		 1475 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.31 
 
 		 2741 aa  45.8  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  20.99 
 
 		 1051 aa  45.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0695  hypothetical protein  31.46 
 
 		 521 aa  44.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  28.21 
 
 		 121 aa  44.3  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  22.7 
 
 		 1611 aa  44.3  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>