86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2842 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2842  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  250  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 949 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  48.08 
 
 		 1009 aa  92.8  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.51 
 
 		 991 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  41.51 
 
 		 1060 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  39.62 
 
 		 809 aa  83.6  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2565  TPR repeat-containing protein  40.57 
 
 		 851 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 883 aa  77.4  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  39.09 
 
 		 192 aa  76.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0363  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.58 
 
 		 1772 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.387099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4137  TPR repeat-containing protein  40.38 
 
 		 868 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000228127  decreased coverage  0.0057951 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  36.89 
 
 		 853 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2488  Tetratricopeptide domain protein  40.38 
 
 		 950 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3620  Tetratricopeptide domain protein  40.38 
 
 		 950 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  42.59 
 
 		 960 aa  74.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  36.79 
 
 		 828 aa  73.6  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 822 aa  73.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  38.83 
 
 		 957 aa  70.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0570  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.65 
 
 		 3535 aa  70.1  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.65 
 
 		 3419 aa  70.1  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  40.18 
 
 		 729 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  33.03 
 
 		 840 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 1215 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0573  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.65 
 
 		 3298 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 		 854 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  39.42 
 
 		 919 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  39.42 
 
 		 1328 aa  68.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.29 
 
 		 1162 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 905 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 905 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 1162 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  35.96 
 
 		 717 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3830  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.22 
 
 		 3537 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.5 
 
 		 968 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1975  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.61 
 
 		 3299 aa  65.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  33.09 
 
 		 447 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  41.75 
 
 		 1054 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  31.62 
 
 		 845 aa  63.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.47 
 
 		 1650 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 846 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  33.33 
 
 		 891 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1636  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  27.14 
 
 		 2637 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191392 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 923 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 		 796 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  35.78 
 
 		 916 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 854 aa  59.3  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1265  hypothetical protein  30.65 
 
 		 553 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0292259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03421  hypothetical protein  34.95 
 
 		 418 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.634587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  41.25 
 
 		 903 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  34.26 
 
 		 1475 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 		 2741 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  34.62 
 
 		 944 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.24 
 
 		 904 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.37 
 
 		 2741 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  31.11 
 
 		 827 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0054  TPR repeat-containing protein  35.51 
 
 		 885 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.494605 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 937 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  34.31 
 
 		 532 aa  55.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.77 
 
 		 1186 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  32.23 
 
 		 1507 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  31.75 
 
 		 371 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1246 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 851 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1409 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  31.86 
 
 		 937 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  34.02 
 
 		 893 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1024 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1039 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 1036 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4247  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 1055 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  32.11 
 
 		 884 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 		 1711 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 928 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  37.66 
 
 		 992 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2387  hypothetical protein  29.31 
 
 		 1051 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 1365 aa  45.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5642  Tetratricopeptide TPR_4  28.21 
 
 		 725 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00884597 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3516  Tetratricopeptide TPR_4  37.84 
 
 		 1049 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.535351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.06 
 
 		 1135 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5481  hypothetical protein  27.18 
 
 		 698 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0491751 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  30.16 
 
 		 1228 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  23.94 
 
 		 1007 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1025 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1025 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  30.68 
 
 		 1266 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1020  hypothetical protein  35.11 
 
 		 565 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>