More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1768 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 923 aa  1889    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.67 
 
 		 1162 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1162 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 1060 aa  203  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.7 
 
 		 991 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 1025 aa  173  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 854 aa  172  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  31.01 
 
 		 782 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  32.09 
 
 		 985 aa  157  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  28.06 
 
 		 989 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.54 
 
 		 2741 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3627  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.68 
 
 		 1135 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.92 
 
 		 828 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  25.67 
 
 		 1266 aa  149  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 1313 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.91 
 
 		 2741 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.72 
 
 		 1186 aa  139  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  32.24 
 
 		 1101 aa  137  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  22.06 
 
 		 1009 aa  134  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 412 aa  131  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.52 
 
 		 725 aa  127  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 1215 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 1063 aa  126  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2097  hypothetical protein  27.89 
 
 		 1024 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 408 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.12 
 
 		 2145 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  31.05 
 
 		 689 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.29 
 
 		 919 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.45 
 
 		 1328 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.77 
 
 		 1238 aa  109  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  28.91 
 
 		 340 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 438 aa  107  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 729 aa  106  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1550 aa  105  5e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.2 
 
 		 809 aa  104  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  30.88 
 
 		 957 aa  100  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 343 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.51 
 
 		 609 aa  100  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.33 
 
 		 968 aa  97.8  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  25.64 
 
 		 903 aa  96.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1212 aa  95.1  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1380  tetratricopeptide TPR_4  25.64 
 
 		 937 aa  93.6  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  26.53 
 
 		 934 aa  94.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  25.85 
 
 		 941 aa  93.2  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.05 
 
 		 1279 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.3 
 
 		 636 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  24.23 
 
 		 1475 aa  90.5  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1246 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.51 
 
 		 1360 aa  89.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  23.43 
 
 		 893 aa  87  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  24.33 
 
 		 532 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 949 aa  87  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  24.92 
 
 		 1914 aa  85.5  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2355  hypothetical protein  28.57 
 
 		 877 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 		 436 aa  83.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  29.32 
 
 		 650 aa  82.4  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 1365 aa  81.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  22.51 
 
 		 717 aa  81.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1404 aa  81.3  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  22.98 
 
 		 1028 aa  81.3  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 760 aa  80.9  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  27.08 
 
 		 357 aa  80.5  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  35.65 
 
 		 916 aa  80.9  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0621  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 368 aa  80.5  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 659 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 1596 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  27.46 
 
 		 788 aa  78.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1450 aa  78.2  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  22.35 
 
 		 884 aa  78.2  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 846 aa  78.2  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.03 
 
 		 560 aa  77.8  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 1714 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  25.57 
 
 		 1147 aa  76.6  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 850 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1987  hypothetical protein  31.43 
 
 		 1039 aa  75.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.45 
 
 		 1295 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1261 aa  75.5  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  25.65 
 
 		 645 aa  75.1  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  27.43 
 
 		 1228 aa  75.1  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  29.31 
 
 		 1054 aa  74.7  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  24.34 
 
 		 1020 aa  74.3  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 775 aa  73.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 545 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  34.82 
 
 		 1054 aa  74.3  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 1048 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  23.32 
 
 		 364 aa  72  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  25.65 
 
 		 919 aa  71.6  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 937 aa  71.6  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 1711 aa  71.2  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 		 852 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3744  transcriptional regulator, XRE family  26.38 
 
 		 814 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.806714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  25.24 
 
 		 490 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  28.43 
 
 		 825 aa  69.7  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  22.12 
 
 		 671 aa  70.1  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0305  Tetratricopeptide domain protein  27.31 
 
 		 603 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 287 aa  69.7  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0354  hypothetical protein  30.95 
 
 		 1025 aa  69.3  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.219727  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  19.56 
 
 		 1779 aa  68.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3192  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1036 aa  68.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.080394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  38.83 
 
 		 928 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>