More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0475 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 1279 aa  2639    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  88.34 
 
 		 1195 aa  2127    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.91 
 
 		 636 aa  334  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1285 aa  264  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.82 
 
 		 1238 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  36.98 
 
 		 1526 aa  207  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 1060 aa  178  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  36.59 
 
 		 941 aa  171  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1298 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.99 
 
 		 991 aa  158  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  32.44 
 
 		 782 aa  151  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  37.88 
 
 		 1266 aa  147  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  38.33 
 
 		 725 aa  135  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 1714 aa  131  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  29.6 
 
 		 828 aa  130  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  35.97 
 
 		 412 aa  127  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  32.93 
 
 		 2145 aa  127  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1596 aa  126  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  27.94 
 
 		 985 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 949 aa  124  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 1450 aa  121  7.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1550 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0583  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 1333 aa  113  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204849  normal  0.7877 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1261 aa  112  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  29.64 
 
 		 957 aa  111  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 909 aa  107  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  27.52 
 
 		 1022 aa  105  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  27 
 
 		 1009 aa  104  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 343 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  25.52 
 
 		 788 aa  99.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  29.68 
 
 		 1404 aa  99.4  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  32.64 
 
 		 1212 aa  97.4  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 4489 aa  97.8  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 681 aa  97.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  24.89 
 
 		 775 aa  95.1  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 3035 aa  94.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  28.53 
 
 		 665 aa  93.2  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 923 aa  93.2  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.96 
 
 		 1094 aa  92.4  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 3145 aa  92.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 1063 aa  92.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  23.91 
 
 		 1914 aa  91.7  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  31.54 
 
 		 1288 aa  90.5  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  25.87 
 
 		 971 aa  90.1  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.77 
 
 		 609 aa  90.5  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 3560 aa  90.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  24.71 
 
 		 809 aa  89  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  30.53 
 
 		 992 aa  88.6  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  27.91 
 
 		 755 aa  88.6  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 872 aa  88.2  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 362 aa  87.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  26.84 
 
 		 689 aa  87.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 878 aa  87.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 545 aa  86.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  26.25 
 
 		 834 aa  85.5  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 356 aa  84.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 1298 aa  84.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 850 aa  84.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  28.45 
 
 		 490 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  25.19 
 
 		 340 aa  84  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 637 aa  83.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  23.2 
 
 		 1694 aa  83.2  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 649 aa  83.2  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 1737 aa  82  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 750 aa  82.4  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.86 
 
 		 810 aa  81.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 1186 aa  80.9  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.15 
 
 		 865 aa  80.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1025 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 408 aa  79.7  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  23.69 
 
 		 962 aa  80.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  24.32 
 
 		 1021 aa  79.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 568 aa  79.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.29 
 
 		 568 aa  79.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  24.77 
 
 		 1106 aa  78.2  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.4 
 
 		 1162 aa  77.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 1313 aa  78.2  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 		 750 aa  77  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1827 aa  77.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.67 
 
 		 2413 aa  77.4  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 1061 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  19.61 
 
 		 1180 aa  76.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 		 3172 aa  76.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  21.01 
 
 		 650 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 1162 aa  75.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.47 
 
 		 764 aa  75.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.85 
 
 		 887 aa  75.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  22.06 
 
 		 685 aa  75.5  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.02 
 
 		 622 aa  74.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.04 
 
 		 725 aa  74.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 		 436 aa  74.3  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 3301 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  21.54 
 
 		 827 aa  73.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2310  diguanylate cyclase  24.78 
 
 		 718 aa  73.2  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 714 aa  73.2  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  25.09 
 
 		 1054 aa  72.4  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 714 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 809 aa  72  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>