More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0229 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  100 
 
 		 689 aa  1404    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  41.06 
 
 		 782 aa  184  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  43.46 
 
 		 985 aa  180  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 		 991 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 1060 aa  154  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  37.55 
 
 		 725 aa  153  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  38.06 
 
 		 1266 aa  147  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  35.54 
 
 		 408 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  32.37 
 
 		 828 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1238 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1101 aa  133  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 1313 aa  129  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 1063 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.2 
 
 		 609 aa  123  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 412 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  26.53 
 
 		 941 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  31.08 
 
 		 2145 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.6 
 
 		 1186 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  30.99 
 
 		 1550 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 		 923 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 343 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.82 
 
 		 809 aa  108  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.89 
 
 		 1213 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  31.19 
 
 		 1009 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.72 
 
 		 1162 aa  104  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  25.83 
 
 		 1914 aa  104  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  23.96 
 
 		 981 aa  104  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 		 636 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 1162 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  26.69 
 
 		 364 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  26.67 
 
 		 340 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  24.1 
 
 		 999 aa  99.4  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.5 
 
 		 957 aa  97.1  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  23.26 
 
 		 825 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1149  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 613 aa  95.5  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.72 
 
 		 1279 aa  95.5  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  27.44 
 
 		 573 aa  93.6  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1209 aa  93.6  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 1025 aa  93.6  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.09 
 
 		 1190 aa  93.2  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  28.42 
 
 		 1208 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  26.23 
 
 		 775 aa  90.9  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  31.76 
 
 		 490 aa  89.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 1714 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 1221 aa  89  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1404 aa  88.2  4e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  22.55 
 
 		 827 aa  87.8  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 		 568 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 568 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1596 aa  87.4  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  28.51 
 
 		 357 aa  87.8  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3332  transcriptional regulator, SARP family  22.11 
 
 		 1025 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00786892  normal  0.331119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 1526 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.96 
 
 		 2413 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  22.13 
 
 		 816 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  30.1 
 
 		 1228 aa  85.9  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  22.07 
 
 		 822 aa  85.1  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 1261 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  23.61 
 
 		 965 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 1071 aa  84.3  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 		 1298 aa  84.3  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 		 949 aa  83.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  25.85 
 
 		 740 aa  83.2  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.38 
 
 		 852 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  24.85 
 
 		 566 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.04 
 
 		 694 aa  82.4  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0901  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 613 aa  82.4  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0436049 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 543 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 751 aa  80.9  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1212 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.79 
 
 		 1188 aa  79  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 1017 aa  78.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 1048 aa  78.2  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 1298 aa  78.2  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  24.02 
 
 		 931 aa  77.8  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 		 907 aa  77.4  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  22.87 
 
 		 834 aa  76.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  24.45 
 
 		 493 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 1450 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  24.79 
 
 		 992 aa  76.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  26.24 
 
 		 1022 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  22.32 
 
 		 462 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2835  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 287 aa  76.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.356723  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 1215 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 850 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 799 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2664  putative PAS/PAC sensor protein  28.15 
 
 		 695 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.228466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  26.86 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.57 
 
 		 927 aa  75.1  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.57 
 
 		 1193 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.32 
 
 		 1104 aa  74.7  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.95 
 
 		 767 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  23.87 
 
 		 1507 aa  74.3  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  23.89 
 
 		 790 aa  73.9  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  26.51 
 
 		 464 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  28.32 
 
 		 1196 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 		 760 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.42 
 
 		 1694 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>