39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1440 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  100 
 
 		 464 aa  943    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  41.32 
 
 		 471 aa  337  3.9999999999999995e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  39.7 
 
 		 460 aa  310  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  35.88 
 
 		 462 aa  276  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  38.56 
 
 		 462 aa  273  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  34.51 
 
 		 477 aa  250  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  28.78 
 
 		 1208 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28.45 
 
 		 1188 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.32 
 
 		 1213 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  28.73 
 
 		 566 aa  189  9e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  28.29 
 
 		 438 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  28.25 
 
 		 1193 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0639  WD repeat-containing protein  38.2 
 
 		 315 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.221679  decreased coverage  0.0018351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 1221 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  30.36 
 
 		 464 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  31.4 
 
 		 1209 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  32.85 
 
 		 1190 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 1196 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1356  NB-ARC  33.44 
 
 		 492 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000010026  normal  0.0147503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.18 
 
 		 1188 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  26.2 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  25.86 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  29.62 
 
 		 1411 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.7 
 
 		 1247 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 791 aa  76.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 783 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  41.86 
 
 		 638 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  26.5 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  24.3 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2826  hypothetical protein  46 
 
 		 111 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2158  ATPase-like  29.91 
 
 		 856 aa  50.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0735  diguanylate cyclase  25.93 
 
 		 303 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 804 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  21.98 
 
 		 916 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  22.13 
 
 		 1100 aa  47  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  22.45 
 
 		 1044 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  22.22 
 
 		 1092 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 910 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  22.75 
 
 		 776 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>