42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4804 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  100 
 
 		 462 aa  938    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  40.53 
 
 		 471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  38.27 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  35.59 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  37.85 
 
 		 460 aa  279  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  35.71 
 
 		 477 aa  259  6e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  29.93 
 
 		 1188 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  28.45 
 
 		 1193 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.97 
 
 		 1213 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  30.79 
 
 		 438 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  29.86 
 
 		 566 aa  199  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0639  WD repeat-containing protein  37.34 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.221679  decreased coverage  0.0018351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 1221 aa  196  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  32.83 
 
 		 464 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  33.98 
 
 		 1209 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1190 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.29 
 
 		 1208 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  31.29 
 
 		 1196 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1356  NB-ARC  29.94 
 
 		 492 aa  129  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000010026  normal  0.0147503 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 1411 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.37 
 
 		 1188 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  25.41 
 
 		 513 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  26.1 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 		 791 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  21.89 
 
 		 1247 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2808  hypothetical protein  26.02 
 
 		 483 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  20.62 
 
 		 783 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2826  hypothetical protein  38.1 
 
 		 111 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 802 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  24.53 
 
 		 689 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  27.27 
 
 		 482 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  20.6 
 
 		 816 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  31.11 
 
 		 648 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2279  NB-ARC domain protein  30.19 
 
 		 1438 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 729 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1989  AAA ATPase  31.2 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  21.69 
 
 		 1056 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6539  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 		 198 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04700  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.19 
 
 		 198 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.162406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 812 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1210  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 198 aa  43.5  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.292938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5412  transcriptional regulator, LuxR family  30.56 
 
 		 155 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207706  normal  0.221863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>