75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3256 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 438 aa  894    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 1221 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  41.24 
 
 		 1190 aa  233  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  40.98 
 
 		 1188 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  44.31 
 
 		 1196 aa  229  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  38.67 
 
 		 566 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  38.21 
 
 		 1193 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  33.65 
 
 		 1213 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  37.39 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  37.65 
 
 		 1208 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  36.51 
 
 		 460 aa  210  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  33.1 
 
 		 471 aa  210  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  36.47 
 
 		 1209 aa  206  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  35.35 
 
 		 462 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  34.63 
 
 		 477 aa  192  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  28.29 
 
 		 464 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  30.79 
 
 		 462 aa  186  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  33.42 
 
 		 513 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1356  NB-ARC  35.89 
 
 		 492 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000010026  normal  0.0147503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0639  WD repeat-containing protein  30.43 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.221679  decreased coverage  0.0018351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  31.13 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.77 
 
 		 1411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.58 
 
 		 1188 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  30.12 
 
 		 1247 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2826  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3056  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 1021 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  29.67 
 
 		 482 aa  63.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  25.61 
 
 		 921 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3215  response regulator receiver protein  38.75 
 
 		 104 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 804 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.04 
 
 		 1131 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1238 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  25.16 
 
 		 931 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  21.76 
 
 		 1145 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  26.76 
 
 		 1288 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  25.71 
 
 		 907 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  25.94 
 
 		 1914 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 973 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  22.77 
 
 		 791 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  26.71 
 
 		 960 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 973 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2808  hypothetical protein  27.03 
 
 		 483 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  25.31 
 
 		 1085 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1714 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  30.77 
 
 		 792 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10398  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 		 335 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 1064 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  47.17 
 
 		 908 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  29.12 
 
 		 1044 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  25.79 
 
 		 793 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 872 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4452  ATPase  29.89 
 
 		 366 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  24.54 
 
 		 982 aa  47  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 915 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  21.65 
 
 		 783 aa  46.6  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  22.77 
 
 		 1087 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 802 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1597  tetratricopeptide TPR_4  29.61 
 
 		 797 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00177125  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  24.03 
 
 		 1043 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  24.55 
 
 		 919 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  24.58 
 
 		 916 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.67 
 
 		 1831 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  24.77 
 
 		 928 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  25.2 
 
 		 755 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  25.9 
 
 		 966 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  25.5 
 
 		 1027 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  39.74 
 
 		 630 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  24.14 
 
 		 1030 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 207 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  34.21 
 
 		 849 aa  43.5  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  27.35 
 
 		 961 aa  43.5  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 726 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  24.79 
 
 		 990 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  25.49 
 
 		 969 aa  43.1  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>