26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4452 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4452  ATPase  100 
 
 		 366 aa  743    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5277  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic contain C-terminal PDZ domain-like protein  53.5 
 
 		 425 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3379  AAA ATPase  27.91 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.562242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  26.98 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4622  AAA ATPase  24.79 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368168 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  25.93 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  25.93 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 802 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  25.64 
 
 		 827 aa  53.9  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0424  AAA ATPase  24.19 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.629135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  27.75 
 
 		 906 aa  53.9  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1898  AAA ATPase  23.31 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3101  transcriptional regulator, SARP family  30.08 
 
 		 910 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.423529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  29.89 
 
 		 438 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  25.47 
 
 		 973 aa  46.6  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  25.2 
 
 		 973 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  25.23 
 
 		 601 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  19.82 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  27.93 
 
 		 901 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 1046 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  23.42 
 
 		 948 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  21.52 
 
 		 948 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  25.47 
 
 		 502 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  27.21 
 
 		 1058 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1461  ABC transporter related  31.71 
 
 		 246 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  23.24 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>