48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2158 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  944    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  944    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  74.78 
 
 
456 aa  726    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  43.08 
 
 
627 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  48.86 
 
 
877 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  48.8 
 
 
457 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  46.71 
 
 
662 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  46.71 
 
 
384 aa  305  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  44.38 
 
 
475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  46.57 
 
 
547 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  45.75 
 
 
456 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  45.75 
 
 
456 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  46.33 
 
 
648 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  45.21 
 
 
446 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  43.8 
 
 
470 aa  298  9e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  44.29 
 
 
450 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  39.84 
 
 
537 aa  297  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  41.9 
 
 
466 aa  282  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  42.2 
 
 
638 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  45.1 
 
 
405 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  40.93 
 
 
520 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  39.28 
 
 
623 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  39.37 
 
 
534 aa  240  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  36.64 
 
 
438 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  35.37 
 
 
491 aa  220  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  29.36 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  27.68 
 
 
500 aa  117  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  42.06 
 
 
117 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  23.79 
 
 
781 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  23.75 
 
 
1214 aa  63.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  23.87 
 
 
902 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  23.87 
 
 
902 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  24.27 
 
 
1908 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  22.32 
 
 
891 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4452  ATPase  26.05 
 
 
366 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.6 
 
 
1163 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  22.18 
 
 
1932 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  23.7 
 
 
1367 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  22.5 
 
 
2077 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  23.87 
 
 
1209 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.83 
 
 
1190 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1447  hypothetical protein  30.7 
 
 
129 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  28.03 
 
 
1161 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  28.03 
 
 
1161 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  21.22 
 
 
1914 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4022  hypothetical protein  22.19 
 
 
854 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864107  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  21.81 
 
 
1177 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  22.05 
 
 
1176 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>