More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5277 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5277  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic contain C-terminal PDZ domain-like protein  100 
 
 
425 aa  876    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4452  ATPase  53.5 
 
 
366 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3713  hypothetical protein  38.1 
 
 
307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554135  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0424  AAA ATPase  26.5 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.629135  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4622  AAA ATPase  26.92 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0368168 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.9 
 
 
507 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3379  AAA ATPase  27.75 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.562242  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  30.97 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.25 
 
 
395 aa  63.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.28 
 
 
386 aa  63.2  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2063  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.46 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239523  hitchhiker  0.000119694 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
363 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  29.48 
 
 
401 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  29.22 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  29.22 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  29.22 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  28.57 
 
 
397 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  32.17 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
403 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.51 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  30.81 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  31.25 
 
 
520 aa  58.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.87 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  32.22 
 
 
471 aa  57.8  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.38 
 
 
393 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  30.72 
 
 
464 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  31.61 
 
 
483 aa  57.4  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  31.46 
 
 
369 aa  57  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  33.9 
 
 
400 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  31.64 
 
 
514 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  31.61 
 
 
474 aa  56.6  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  30.77 
 
 
393 aa  56.6  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  32.74 
 
 
488 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  31.67 
 
 
471 aa  56.2  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  30.57 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  31.67 
 
 
502 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  31.61 
 
 
464 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  31.03 
 
 
461 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  31.43 
 
 
485 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  31.03 
 
 
485 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  31.67 
 
 
502 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  28.74 
 
 
493 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  29.07 
 
 
458 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  31.43 
 
 
502 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  29.14 
 
 
490 aa  55.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  31.43 
 
 
502 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  31.67 
 
 
502 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  30.59 
 
 
492 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  30.77 
 
 
473 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  29.14 
 
 
476 aa  54.7  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.38 
 
 
389 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  30.99 
 
 
476 aa  54.3  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  34.27 
 
 
453 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  31.91 
 
 
502 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.89 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  25.97 
 
 
397 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2658  protease signal peptide protein  32.04 
 
 
502 aa  53.9  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  30.51 
 
 
509 aa  53.9  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  28.9 
 
 
516 aa  53.9  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  29.58 
 
 
382 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  30.51 
 
 
491 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  30.2 
 
 
395 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0037  protease Do  30.11 
 
 
489 aa  53.5  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  28.57 
 
 
498 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15600  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  23.73 
 
 
393 aa  53.1  0.000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0395297  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  29.21 
 
 
457 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  29.71 
 
 
473 aa  53.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  31.03 
 
 
502 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  29.71 
 
 
503 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  30.46 
 
 
500 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  22.01 
 
 
334 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.22 
 
 
397 aa  52.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  29.71 
 
 
503 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1898  AAA ATPase  25.51 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  30.86 
 
 
498 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.78 
 
 
640 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.58 
 
 
391 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  26.67 
 
 
392 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4479  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.14 
 
 
307 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  30.46 
 
 
490 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  30.46 
 
 
499 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  31.21 
 
 
495 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  31.21 
 
 
501 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  30.86 
 
 
498 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  33.79 
 
 
379 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  30.86 
 
 
498 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  30.46 
 
 
499 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  28.68 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0436  hypothetical protein  28.65 
 
 
665 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.871831  normal  0.17474 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  29.5 
 
 
370 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  30.94 
 
 
478 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  30.86 
 
 
511 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.49 
 
 
450 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.65 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  28.73 
 
 
528 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  26.47 
 
 
432 aa  51.6  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  30.68 
 
 
479 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  30.86 
 
 
481 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  28.98 
 
 
481 aa  50.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  30.68 
 
 
389 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>