More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0510 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  100 
 
 
399 aa  781    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  48.11 
 
 
397 aa  346  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  48.36 
 
 
397 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  50.38 
 
 
401 aa  342  7e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  48.61 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  48.61 
 
 
395 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  48.36 
 
 
395 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  48.88 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  44.02 
 
 
395 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.07 
 
 
397 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.48 
 
 
392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.75 
 
 
392 aa  273  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  42.15 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  44.78 
 
 
394 aa  269  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  39.01 
 
 
399 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  40.21 
 
 
394 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.65 
 
 
395 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.88 
 
 
393 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  39.63 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  37.91 
 
 
392 aa  233  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.43 
 
 
392 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  37.84 
 
 
397 aa  227  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  40.05 
 
 
393 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  42.11 
 
 
394 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.12 
 
 
402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  36.17 
 
 
394 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  34.19 
 
 
398 aa  167  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.53 
 
 
391 aa  163  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.83 
 
 
394 aa  161  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  34.18 
 
 
383 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.4 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  33.15 
 
 
424 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  37.33 
 
 
357 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  37.33 
 
 
373 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  35.14 
 
 
497 aa  81.3  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  39.61 
 
 
506 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  41.03 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2025  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.59 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.591638  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.76 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  33.12 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  35.54 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.68 
 
 
401 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  37.06 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  33.54 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  32.91 
 
 
402 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  32.91 
 
 
402 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.79 
 
 
484 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.79 
 
 
481 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  39.07 
 
 
493 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
483 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  40.69 
 
 
514 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  34.04 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  32.07 
 
 
415 aa  74.3  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  33.96 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  34.86 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  31.03 
 
 
481 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  34.18 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.61 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  32.08 
 
 
487 aa  73.2  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  31.49 
 
 
479 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  30.43 
 
 
479 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  35.12 
 
 
502 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  31.87 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.06 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  34.16 
 
 
525 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  36.67 
 
 
511 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3599  periplasmic serine protease DegS  33.33 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4226  periplasmic serine protease DegS  32.75 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  34 
 
 
383 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  35.8 
 
 
323 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  32.57 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  34.68 
 
 
353 aa  71.2  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  34.29 
 
 
513 aa  70.9  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  31.44 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  34.51 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0741  periplasmic serine protease DegS  30.41 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.905633  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.67 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 
516 aa  70.5  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  31.06 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  31.06 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.22 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  32.28 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  34.13 
 
 
464 aa  70.1  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  32.28 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  38.71 
 
 
501 aa  70.1  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  30.64 
 
 
492 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  34.97 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  33.14 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0689  DegS serine peptidase  29.82 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  hitchhiker  0.000493421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.94 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  28.95 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  32.28 
 
 
385 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  33.71 
 
 
308 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  28.95 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  28.95 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  28.95 
 
 
360 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  31.07 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  33.33 
 
 
523 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  28.26 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>