More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0443 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 389 aa  758    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  45.99 
 
 		 383 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.72 
 
 		 395 aa  170  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  33.08 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  29.52 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  31.57 
 
 		 392 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33 
 
 		 392 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  32.01 
 
 		 397 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  32.28 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  32.28 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  32.28 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  33.08 
 
 		 401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.03 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.77 
 
 		 392 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.85 
 
 		 392 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.19 
 
 		 402 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  32.66 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  34.2 
 
 		 394 aa  149  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 391 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  30.29 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  31.92 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  32.23 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  28.72 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  35.49 
 
 		 394 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  29.32 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  31.25 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  30.35 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.86 
 
 		 397 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.52 
 
 		 394 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  31.35 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  28.5 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  35.75 
 
 		 432 aa  85.9  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  36.54 
 
 		 488 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  32.37 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.8 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.04 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  32.09 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1154  2-alkenal reductase  32.61 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1175  2-alkenal reductase  32.09 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  36.54 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  36.31 
 
 		 520 aa  63.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  33.72 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3344  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.06 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  31.98 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.34 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  36.48 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  31.25 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.08 
 
 		 486 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  34.88 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22490  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  30.37 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  35.98 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  34.94 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  32.52 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.18 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0422  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.82 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  32.3 
 
 		 494 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  34.15 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  35.26 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  35.26 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1313  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.7 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  35.56 
 
 		 584 aa  59.7  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5907  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.84 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  32.56 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  33.71 
 
 		 499 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.46 
 
 		 481 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.46 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.52 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.56 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.12 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  31.52 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1578  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.57 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.5845  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  36.42 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  35.03 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  30.49 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  33.16 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  26.67 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.7 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  29.14 
 
 		 502 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12621  hypothetical protein  29.65 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  29.67 
 
 		 511 aa  57.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  31.55 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  35.8 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  32.3 
 
 		 494 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  29.82 
 
 		 475 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.12 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  31.68 
 
 		 493 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  31.68 
 
 		 493 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  31.68 
 
 		 493 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1719  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.56 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000748788  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15600  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  34.94 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0395297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  28.69 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0739  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.92 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.65 
 
 		 426 aa  56.2  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  30.52 
 
 		 483 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  29.41 
 
 		 500 aa  56.2  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  35.03 
 
 		 501 aa  56.2  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  32.3 
 
 		 503 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  36.54 
 
 		 478 aa  56.2  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>