More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4316 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 392 aa  767    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  91.58 
 
 		 392 aa  689    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  54.22 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  47.35 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  46.04 
 
 		 392 aa  328  7e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.74 
 
 		 392 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.45 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.23 
 
 		 393 aa  302  7.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  46.94 
 
 		 393 aa  299  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  42.93 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  43.51 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  44.39 
 
 		 397 aa  286  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  44.95 
 
 		 394 aa  285  7e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  41.25 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  42.53 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  42.51 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  42.51 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  42.51 
 
 		 395 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.09 
 
 		 395 aa  277  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  41.93 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  43.62 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  45.5 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  43.73 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  39.8 
 
 		 401 aa  239  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.31 
 
 		 391 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.26 
 
 		 402 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  39.72 
 
 		 398 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  33.86 
 
 		 394 aa  185  9e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  37.28 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.51 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  37.31 
 
 		 432 aa  99.4  9e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.43 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  35.2 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.26 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  34.88 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  34.88 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  33.86 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  35.47 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  34.29 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  34.29 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  33.72 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1143  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.12 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  34.97 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  35.8 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2484  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.12 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.99 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  30.84 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  34.41 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.22 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  32.16 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  31.52 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  32.39 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  35.53 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  30.18 
 
 		 459 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.33 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  34.03 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.05 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.11 
 
 		 426 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0739  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.54 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  28.88 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.15 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  32.97 
 
 		 419 aa  62.8  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  37.06 
 
 		 520 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36 
 
 		 288 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.473362  hitchhiker  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.9 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  33.14 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  34.24 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  31.22 
 
 		 525 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  29.76 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  33.71 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0103  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.36 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  28.35 
 
 		 264 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1716  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.319195 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  33.91 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  31.89 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  28.32 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.53 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0422  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.85 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  29.17 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1248  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.67 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.490271 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  29.17 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  34.52 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  28.04 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  34.52 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  32.04 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2314  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.52 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.31 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  37.06 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  32.47 
 
 		 584 aa  60.1  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0037  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.64 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.65 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  35.88 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.08 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  33.54 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.27 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  31.18 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>