More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2684 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  100 
 
 		 391 aa  781    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  45.03 
 
 		 506 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  45.03 
 
 		 493 aa  256  5e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  44.57 
 
 		 493 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  43.75 
 
 		 483 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  43.75 
 
 		 483 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  46.76 
 
 		 496 aa  246  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  44.25 
 
 		 483 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  44.71 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  46.18 
 
 		 502 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  42.5 
 
 		 501 aa  242  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  41.92 
 
 		 513 aa  241  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  45.74 
 
 		 503 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  45.74 
 
 		 503 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  47.12 
 
 		 515 aa  241  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  46.55 
 
 		 501 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  38.94 
 
 		 476 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  47.06 
 
 		 496 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  47.06 
 
 		 496 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  40 
 
 		 452 aa  239  5e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  46.55 
 
 		 504 aa  239  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  41.64 
 
 		 464 aa  239  8e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  42.68 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  40.06 
 
 		 501 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  41 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  38.1 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  42.46 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  39.82 
 
 		 396 aa  237  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  40.77 
 
 		 500 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  41.25 
 
 		 459 aa  236  6e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  41.84 
 
 		 456 aa  236  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  42.38 
 
 		 499 aa  236  7e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  44.93 
 
 		 524 aa  235  8e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  43.67 
 
 		 508 aa  235  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  42.72 
 
 		 473 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  42.31 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  42.77 
 
 		 491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  42.6 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  40.65 
 
 		 523 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  41.8 
 
 		 588 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  41.8 
 
 		 578 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  40.35 
 
 		 385 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  41.25 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.73 
 
 		 412 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.35 
 
 		 384 aa  234  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  43.27 
 
 		 476 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  40.06 
 
 		 398 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7809  serine protease do-like precursor  43.15 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  41.57 
 
 		 476 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  40.91 
 
 		 477 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  40.91 
 
 		 477 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  38.99 
 
 		 471 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  41.47 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.26 
 
 		 386 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  39.88 
 
 		 528 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  40.12 
 
 		 482 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  41.07 
 
 		 523 aa  230  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  45.51 
 
 		 501 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  43.48 
 
 		 400 aa  230  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  39.83 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  40.81 
 
 		 523 aa  230  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  42.11 
 
 		 522 aa  229  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  42.12 
 
 		 479 aa  229  5e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.84 
 
 		 398 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.09 
 
 		 475 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  39.4 
 
 		 487 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  41.54 
 
 		 506 aa  229  9e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  43.57 
 
 		 529 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  41.64 
 
 		 528 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  39.58 
 
 		 516 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  36.2 
 
 		 528 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  39.64 
 
 		 526 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  44.48 
 
 		 471 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  43.32 
 
 		 537 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  38.92 
 
 		 527 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  42.07 
 
 		 465 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  38.08 
 
 		 474 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  39.29 
 
 		 510 aa  226  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  44.01 
 
 		 461 aa  226  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  45.2 
 
 		 498 aa  226  7e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  40.69 
 
 		 380 aa  225  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  42.2 
 
 		 535 aa  225  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  45.16 
 
 		 509 aa  226  8e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  39.82 
 
 		 484 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  38.54 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.97 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  40.06 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  43.82 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  40.37 
 
 		 450 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  44.6 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  40.18 
 
 		 504 aa  223  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  44.6 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  39.3 
 
 		 404 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  44.6 
 
 		 502 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  44.6 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  40.37 
 
 		 450 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  40.37 
 
 		 450 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  44.6 
 
 		 502 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  40.06 
 
 		 474 aa  223  4e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  40.06 
 
 		 474 aa  223  4e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>