More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4292 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  100 
 
 		 394 aa  766    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  71.84 
 
 		 393 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  48.73 
 
 		 392 aa  340  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.38 
 
 		 392 aa  326  5e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  46.44 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.89 
 
 		 395 aa  306  6e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  44.68 
 
 		 399 aa  302  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  46.07 
 
 		 402 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.92 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  44.04 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  44.92 
 
 		 393 aa  288  8e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.05 
 
 		 397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.12 
 
 		 392 aa  285  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  45.29 
 
 		 397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.57 
 
 		 391 aa  253  6e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  41.38 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  41.38 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  41.38 
 
 		 395 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  40.59 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  39.9 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  40.44 
 
 		 397 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  41.53 
 
 		 394 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  37.63 
 
 		 401 aa  220  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.76 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  39.44 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  36.58 
 
 		 394 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  39.9 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.94 
 
 		 394 aa  190  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  35.36 
 
 		 398 aa  169  8e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  36.5 
 
 		 383 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.26 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  31.25 
 
 		 432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  28.44 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0669  2-alkenal reductase  35.19 
 
 		 524 aa  66.2  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.16 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  33.14 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  32.28 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  30.95 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  33.57 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  32.34 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  31.43 
 
 		 525 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  31.25 
 
 		 500 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  35.71 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4410  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.57 
 
 		 584 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  32.86 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  28.07 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3947  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.95 
 
 		 541 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0037  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.39 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  29.01 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  28.65 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  34.48 
 
 		 400 aa  59.7  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  34.03 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  32.86 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  33.1 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  34.27 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  33.1 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  33.57 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  30.39 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.57 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.54 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  31.09 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.46 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  27.88 
 
 		 400 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  32.41 
 
 		 459 aa  57  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.56 
 
 		 752 aa  57  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248292 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  32.41 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  28.9 
 
 		 444 aa  57  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  30 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  32.35 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  32.24 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  27.68 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3074  protease DegS  30.43 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.940129  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.22 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  31.28 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  30 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  30.71 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5787  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.53 
 
 		 526 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  31.28 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  30.12 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  31.43 
 
 		 487 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.86 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1904  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.45 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0620222  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1278  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.18 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  31.43 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  33.57 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  32.86 
 
 		 494 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.67 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  27.47 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.11 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.27 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2025  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.96 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.591638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3851  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.02 
 
 		 558 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.21 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.02 
 
 		 558 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.11 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.84 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.23 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1096  2-alkenal reductase  26.92 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000450263  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5280  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.44 
 
 		 341 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>