More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2582 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 
352 aa  685    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  67.46 
 
 
358 aa  438  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0103  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.7 
 
 
367 aa  290  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  37.29 
 
 
535 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.03 
 
 
368 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  33.14 
 
 
368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  35.86 
 
 
469 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  36.52 
 
 
374 aa  151  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  33.22 
 
 
502 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  33.22 
 
 
502 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  33.22 
 
 
461 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  33.22 
 
 
502 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  33.22 
 
 
485 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  33.22 
 
 
502 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  33.22 
 
 
502 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  34.48 
 
 
509 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  32.87 
 
 
485 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  31.15 
 
 
473 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  35.29 
 
 
483 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  32.53 
 
 
500 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  32.87 
 
 
490 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  33.79 
 
 
455 aa  146  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  33.79 
 
 
455 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  33.79 
 
 
455 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  33.79 
 
 
455 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  33.79 
 
 
455 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  33.79 
 
 
455 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  33.79 
 
 
455 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  33.79 
 
 
455 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  32.53 
 
 
499 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  32.53 
 
 
499 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  31.35 
 
 
514 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  34.14 
 
 
455 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  35.06 
 
 
396 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  34.66 
 
 
418 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.08 
 
 
394 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  29.81 
 
 
452 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  31.83 
 
 
502 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  30 
 
 
459 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  35.03 
 
 
489 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.05 
 
 
366 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  31.51 
 
 
476 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.48 
 
 
383 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  34.13 
 
 
511 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  32.18 
 
 
505 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  35.55 
 
 
523 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  35.55 
 
 
524 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  32.53 
 
 
507 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  33.01 
 
 
467 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  35.81 
 
 
481 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  34.26 
 
 
483 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  32.53 
 
 
498 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  31.8 
 
 
451 aa  144  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  34.26 
 
 
483 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  30.52 
 
 
459 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  33.52 
 
 
418 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  33.22 
 
 
501 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  32.53 
 
 
498 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  32.53 
 
 
498 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.04 
 
 
372 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  32.76 
 
 
491 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  35.47 
 
 
524 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  31.02 
 
 
514 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  34.92 
 
 
489 aa  142  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  31.8 
 
 
451 aa  142  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  32.88 
 
 
500 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  35.84 
 
 
471 aa  142  9.999999999999999e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  33.45 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0810  2-alkenal reductase  29.86 
 
 
487 aa  141  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.810469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.6 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  34.02 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  31.85 
 
 
513 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  32.11 
 
 
498 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  34 
 
 
525 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  30.77 
 
 
508 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  31.18 
 
 
451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  31.12 
 
 
464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  32.87 
 
 
494 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  32.41 
 
 
455 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  29.77 
 
 
473 aa  139  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  32.41 
 
 
455 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  32.41 
 
 
455 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  33.33 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  32.66 
 
 
403 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  37.5 
 
 
460 aa  139  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  33.22 
 
 
497 aa  139  1e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  32.41 
 
 
455 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  34.34 
 
 
475 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  33.11 
 
 
495 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  31.97 
 
 
473 aa  138  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  32.08 
 
 
471 aa  137  2e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  33.11 
 
 
495 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  33.11 
 
 
495 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  33.11 
 
 
483 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  32.45 
 
 
495 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  31.18 
 
 
455 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  33.11 
 
 
483 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  28.26 
 
 
453 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  33.11 
 
 
483 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  31.64 
 
 
389 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>