More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1904 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1904  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
416 aa  842    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0620222  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3344  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  58.88 
 
 
414 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  37.29 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1030  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.93 
 
 
318 aa  87  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.652034  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.48 
 
 
318 aa  86.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1719  HtrA2 peptidase  37.74 
 
 
233 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.95 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1037  serine protease  29.6 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0643787  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  34.68 
 
 
475 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  34.29 
 
 
459 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_002936  DET1036  serine protease  32.41 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000475095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  33.33 
 
 
525 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  31.3 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  33.14 
 
 
501 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0739  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.68 
 
 
371 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  34.3 
 
 
474 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.3 
 
 
474 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  32.49 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  40 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  34.5 
 
 
514 aa  81.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  34.87 
 
 
527 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  29.86 
 
 
476 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  31.4 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.3 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  38.36 
 
 
499 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  31.4 
 
 
382 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  38.69 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  33.88 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  39.57 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  31.25 
 
 
480 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  34.29 
 
 
511 aa  79.7  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  35.63 
 
 
493 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  35.63 
 
 
506 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2484  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.46 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  33.96 
 
 
459 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  36.07 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.77 
 
 
450 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  30.53 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  35.87 
 
 
397 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  35.2 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0754  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.27 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  31.17 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2210  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.93 
 
 
319 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  35.87 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.21 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  35.06 
 
 
520 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.16 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  36.21 
 
 
400 aa  78.2  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  31.71 
 
 
485 aa  78.2  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1064  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.1 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235615  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  34.12 
 
 
493 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  32.94 
 
 
442 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0918  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.15 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000713648  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  28.95 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.79 
 
 
506 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  32.51 
 
 
379 aa  77  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.95 
 
 
375 aa  77  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  32 
 
 
500 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.39 
 
 
386 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  31.84 
 
 
473 aa  77  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2598  trypsin family protein  36.02 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  34.07 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2267  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.72 
 
 
803 aa  76.6  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.489099  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  34.83 
 
 
522 aa  76.6  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  39.57 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0037  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.52 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  31.23 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  35.56 
 
 
511 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  33.33 
 
 
524 aa  75.9  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  33.33 
 
 
524 aa  75.9  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.12 
 
 
381 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  29.52 
 
 
462 aa  75.9  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  34.46 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.73 
 
 
357 aa  75.5  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  32.03 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  40 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  34.46 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  39.86 
 
 
501 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  31.43 
 
 
471 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  33.14 
 
 
483 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  39.01 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  35.36 
 
 
511 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0500  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.39 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058985  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  32.78 
 
 
524 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  30.59 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2505  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.93 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  35.36 
 
 
511 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1143  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.14 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_906  serine protease, DegP/HtrA family  34.31 
 
 
251 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000453115  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  33.14 
 
 
483 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  35.57 
 
 
523 aa  74.7  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  32.2 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  35.53 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  31.18 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.63 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.55 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  35.2 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.52 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  32.76 
 
 
588 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  31.25 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>