More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1068 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  100 
 
 
397 aa  786    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.22 
 
 
392 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  55.26 
 
 
392 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  43.65 
 
 
392 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  42.63 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.46 
 
 
392 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  44.53 
 
 
402 aa  298  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  45.24 
 
 
394 aa  292  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.36 
 
 
393 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  43.88 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.89 
 
 
397 aa  280  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  39.79 
 
 
399 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  40.05 
 
 
394 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  41.29 
 
 
395 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  41.29 
 
 
395 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  41.29 
 
 
395 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  44.21 
 
 
394 aa  259  7e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.16 
 
 
395 aa  258  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  38.83 
 
 
397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  39.36 
 
 
397 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  40.51 
 
 
395 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  38.52 
 
 
401 aa  239  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  40.46 
 
 
397 aa  236  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  37.91 
 
 
399 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.05 
 
 
391 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  35.53 
 
 
398 aa  207  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.99 
 
 
402 aa  202  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.27 
 
 
394 aa  184  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  33.86 
 
 
394 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  36.52 
 
 
383 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.84 
 
 
389 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  37.56 
 
 
432 aa  106  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  33.7 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  33.7 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  32.07 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  31.75 
 
 
461 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.68 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  34.41 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  35.83 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  34.43 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  28.03 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  33.72 
 
 
411 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.8 
 
 
401 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.06 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.32 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.73 
 
 
362 aa  66.2  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  31.98 
 
 
385 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  28.99 
 
 
500 aa  64.7  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  30.98 
 
 
473 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  27.98 
 
 
459 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.78 
 
 
384 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  26.07 
 
 
393 aa  63.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  29.89 
 
 
464 aa  63.5  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  26.5 
 
 
264 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  32.08 
 
 
525 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  30.54 
 
 
453 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  33.33 
 
 
462 aa  63.2  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  30.89 
 
 
402 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  37.1 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  30.34 
 
 
464 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  31.87 
 
 
485 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  28.49 
 
 
466 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  34.59 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
387 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0500  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.33 
 
 
347 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058985  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  28.57 
 
 
485 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  33.15 
 
 
373 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  31.67 
 
 
403 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  29.48 
 
 
483 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  33.15 
 
 
357 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  32.43 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1716  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.26 
 
 
280 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.319195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  31.95 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  31.75 
 
 
453 aa  60.5  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  30.38 
 
 
385 aa  60.1  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.51 
 
 
386 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 
480 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  29.55 
 
 
480 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  33.33 
 
 
376 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  23.71 
 
 
444 aa  59.7  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  31.82 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  30.56 
 
 
474 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  31.58 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  29.03 
 
 
476 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  30.05 
 
 
475 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  34.51 
 
 
537 aa  58.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  33.99 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  28.37 
 
 
493 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  35.26 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.15 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  34.21 
 
 
370 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  28.72 
 
 
453 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  30.18 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  29.19 
 
 
474 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  31.23 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  34.21 
 
 
484 aa  57.8  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  34.51 
 
 
472 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  27.66 
 
 
419 aa  57.8  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  28.42 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.66 
 
 
283 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>