More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2025 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2025  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 375 aa  731    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.591638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2185  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.9 
 
 		 384 aa  212  7.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.523435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1607  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.2 
 
 		 349 aa  172  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0642705  normal  0.0199197 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1119  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.58 
 
 		 344 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000021157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  33.33 
 
 		 502 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  27.95 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.54 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  32.52 
 
 		 504 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  30.25 
 
 		 501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  29.27 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  30.06 
 
 		 503 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  30.06 
 
 		 503 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  29.89 
 
 		 527 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.62 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  28.91 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  29.34 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  30 
 
 		 496 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5280  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.01 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  29.54 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.77 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  29.68 
 
 		 496 aa  113  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  29.68 
 
 		 496 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5001  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.68 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4912  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.68 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.899758  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  27.32 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  28.12 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  30.6 
 
 		 529 aa  110  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  29.03 
 
 		 528 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  29.45 
 
 		 516 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.14 
 
 		 368 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  28.47 
 
 		 528 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.48 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  28.92 
 
 		 520 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  30.99 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  27.13 
 
 		 482 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  29.18 
 
 		 523 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  26.54 
 
 		 473 aa  107  3e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4948  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.88 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809867  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  29.12 
 
 		 503 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  32.64 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  26.74 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  28.3 
 
 		 506 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  29.62 
 
 		 525 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  32.19 
 
 		 395 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  31.4 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.84 
 
 		 386 aa  106  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  27.97 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  28.47 
 
 		 523 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  25 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  29.21 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  29.05 
 
 		 396 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  28.67 
 
 		 537 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1278  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.13 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  26.92 
 
 		 464 aa  103  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  28.05 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  30.77 
 
 		 385 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  30.66 
 
 		 491 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  27.21 
 
 		 464 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  29.34 
 
 		 460 aa  102  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  28.53 
 
 		 396 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  31.47 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.99 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  27.08 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  30.42 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  28.8 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  28.77 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  30.07 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  26.13 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  30.07 
 
 		 485 aa  101  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.43 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  27.42 
 
 		 502 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  29.25 
 
 		 524 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.26 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  30.77 
 
 		 461 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.17 
 
 		 372 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  27.74 
 
 		 504 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.17 
 
 		 487 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  28.49 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  27.24 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  27.55 
 
 		 474 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  27.55 
 
 		 474 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  28.16 
 
 		 479 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  26.13 
 
 		 459 aa  99.8  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  30 
 
 		 393 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  30.15 
 
 		 372 aa  99.4  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5537  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  30.99 
 
 		 335 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  28.97 
 
 		 477 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  27.87 
 
 		 493 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  31.6 
 
 		 461 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  29.71 
 
 		 485 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0103  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.61 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  27.34 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  27.6 
 
 		 477 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  27.87 
 
 		 506 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  28.32 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  27.62 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  29.15 
 
 		 462 aa  97.8  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  27.6 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  28.97 
 
 		 477 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>