More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2185 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2185  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 384 aa  756    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.523435 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2025  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.9 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.591638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1607  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.69 
 
 		 349 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0642705  normal  0.0199197 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1119  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.73 
 
 		 344 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000021157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  32.38 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  32.38 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  31.97 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  31.8 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.8 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  27.68 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.56 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  35.02 
 
 		 504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  34.38 
 
 		 502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  31.86 
 
 		 411 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  33.1 
 
 		 496 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  31.65 
 
 		 527 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  32.32 
 
 		 528 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  29.22 
 
 		 389 aa  116  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  32.66 
 
 		 369 aa  116  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  31.65 
 
 		 523 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  29.9 
 
 		 503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  34.65 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  27.83 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  31.99 
 
 		 526 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  27.83 
 
 		 459 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0703  2-alkenal reductase  26.69 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  31.99 
 
 		 523 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  30.97 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  28.79 
 
 		 482 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  29.58 
 
 		 503 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  33.77 
 
 		 524 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  28.66 
 
 		 502 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  31.48 
 
 		 537 aa  113  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  29.47 
 
 		 514 aa  113  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  30.87 
 
 		 501 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  29.47 
 
 		 505 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 		 405 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  30.03 
 
 		 396 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  33.66 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  33.77 
 
 		 524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  28.53 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  27.56 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  27.56 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  27.56 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  27.56 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  33.77 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  29.41 
 
 		 498 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.7 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  27.56 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  27.56 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  30.41 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  27.56 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  30.41 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  27.56 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  28.95 
 
 		 496 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  27.56 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  31.43 
 
 		 404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  32.18 
 
 		 508 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  29.18 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  30.77 
 
 		 493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  32.45 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  26.07 
 
 		 453 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  31.43 
 
 		 404 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.17 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  30.98 
 
 		 516 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  28.71 
 
 		 500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  32.2 
 
 		 520 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  28.38 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  28.53 
 
 		 507 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  29.06 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  32.31 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  29.06 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  28.71 
 
 		 499 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  29.06 
 
 		 502 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  29.28 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  27.1 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  29.06 
 
 		 502 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  29.93 
 
 		 471 aa  110  6e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  29.06 
 
 		 502 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  28.71 
 
 		 499 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  29.06 
 
 		 485 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  31.74 
 
 		 503 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  29.43 
 
 		 498 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  29.14 
 
 		 514 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  28.81 
 
 		 475 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  27.12 
 
 		 409 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  30.98 
 
 		 528 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  31.74 
 
 		 503 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4948  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.5 
 
 		 374 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809867  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  29.06 
 
 		 461 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  29.73 
 
 		 471 aa  109  9.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  28.04 
 
 		 408 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  32.11 
 
 		 503 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0970  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.14 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  32.79 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  31.71 
 
 		 496 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  32.03 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  31.8 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.47 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>