More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1119 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1119  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
344 aa  673    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000021157  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1607  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.87 
 
 
349 aa  255  9e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0642705  normal  0.0199197 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2185  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.47 
 
 
384 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.523435 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2025  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.5 
 
 
375 aa  149  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.591638  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  34.04 
 
 
418 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  30.84 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.42 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  31.23 
 
 
475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.97 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  30.45 
 
 
368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  28.12 
 
 
389 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  32.94 
 
 
418 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  31.29 
 
 
374 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  32.03 
 
 
375 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  33.57 
 
 
481 aa  123  6e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  32.01 
 
 
508 aa  122  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  29.41 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  31.25 
 
 
413 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  33.1 
 
 
535 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  30.03 
 
 
396 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.47 
 
 
372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.41 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.36 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  31.93 
 
 
502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  33.22 
 
 
504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  31.05 
 
 
523 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  34.07 
 
 
487 aa  116  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  32.06 
 
 
527 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  34.42 
 
 
500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  33.1 
 
 
496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  34.42 
 
 
501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  30.48 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  33.33 
 
 
511 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  29.55 
 
 
473 aa  114  3e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  33.33 
 
 
511 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  31.16 
 
 
502 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  30.58 
 
 
490 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  31.16 
 
 
502 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  29.66 
 
 
499 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  31.16 
 
 
502 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  33.22 
 
 
365 aa  113  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  28.65 
 
 
381 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  30.24 
 
 
499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  30.21 
 
 
498 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  31.16 
 
 
502 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  28.98 
 
 
459 aa  113  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  31.16 
 
 
502 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  28.98 
 
 
459 aa  113  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  30.21 
 
 
498 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  30.21 
 
 
498 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  29.68 
 
 
453 aa  113  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 
384 aa  113  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  32.52 
 
 
374 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  31.16 
 
 
485 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  31.16 
 
 
461 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  29.85 
 
 
384 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  31.25 
 
 
503 aa  112  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  28.12 
 
 
379 aa  112  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  31.25 
 
 
503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  32.76 
 
 
496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  31.5 
 
 
491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  32.12 
 
 
496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  29.9 
 
 
500 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  29.79 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  29.15 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  30.8 
 
 
485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  32.62 
 
 
511 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  31.94 
 
 
496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  31.67 
 
 
487 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.69 
 
 
386 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0970  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.41 
 
 
411 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  27.62 
 
 
403 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  33.68 
 
 
523 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  30.43 
 
 
507 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  29.58 
 
 
502 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  32.39 
 
 
498 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  31.43 
 
 
493 aa  110  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  30.54 
 
 
483 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  27.27 
 
 
453 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  31.54 
 
 
379 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  30.54 
 
 
483 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  32.48 
 
 
497 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  32.28 
 
 
501 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  30.77 
 
 
482 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  27.74 
 
 
453 aa  109  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  31.71 
 
 
526 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  30.8 
 
 
491 aa  109  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  32.01 
 
 
496 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  29.65 
 
 
425 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  29.85 
 
 
457 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  25.43 
 
 
471 aa  108  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  30.31 
 
 
516 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  29.71 
 
 
522 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  26.57 
 
 
408 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  29.45 
 
 
469 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  32.51 
 
 
493 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.72 
 
 
423 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  29.97 
 
 
523 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  30.07 
 
 
505 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  26.57 
 
 
408 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>