More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1278 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1278  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 
297 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5537  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  83.84 
 
 
335 aa  486  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5280  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  74.24 
 
 
341 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5001  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  73.9 
 
 
341 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4912  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  73.9 
 
 
341 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.899758  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10126  serine protease pepA  49.49 
 
 
355 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.16358e-29  normal  0.942677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4674  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.64 
 
 
423 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  33.74 
 
 
389 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.06 
 
 
487 aa  142  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15600  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  35.81 
 
 
393 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0395297  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  33.79 
 
 
453 aa  136  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  31.91 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  37.19 
 
 
395 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  30.93 
 
 
453 aa  130  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  35.77 
 
 
385 aa  129  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  36.11 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  32.18 
 
 
453 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  33.09 
 
 
459 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.75 
 
 
384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  33.09 
 
 
459 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  36.82 
 
 
461 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  35.52 
 
 
351 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  33.57 
 
 
348 aa  127  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  34.72 
 
 
453 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  34.51 
 
 
402 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.46 
 
 
415 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  32.33 
 
 
379 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.56 
 
 
339 aa  124  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  30.51 
 
 
452 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  35.06 
 
 
385 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  35.02 
 
 
509 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1464  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  36.27 
 
 
360 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  34.96 
 
 
577 aa  123  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  34.95 
 
 
481 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  30.39 
 
 
442 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  36.26 
 
 
397 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  33.45 
 
 
535 aa  122  8e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  32.76 
 
 
473 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0798  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  33.44 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  35.13 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  34.97 
 
 
502 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  34.75 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  33.09 
 
 
511 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  34.86 
 
 
461 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  34.24 
 
 
495 aa  120  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  30.39 
 
 
459 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.49 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.1 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  34.86 
 
 
502 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  34.86 
 
 
502 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  34.86 
 
 
502 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  34.86 
 
 
502 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  32.23 
 
 
480 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  34.86 
 
 
502 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  34.86 
 
 
485 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3537  2-alkenal reductase  33.46 
 
 
387 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.355186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  34.47 
 
 
494 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  34.43 
 
 
389 aa  119  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  31.79 
 
 
382 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  32.65 
 
 
377 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  31.62 
 
 
380 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.21 
 
 
450 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_002936  DET1037  serine protease  32.65 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0643787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  34.72 
 
 
516 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  32.62 
 
 
485 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  34.51 
 
 
485 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  33.21 
 
 
487 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  32.72 
 
 
411 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  35 
 
 
500 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  34.25 
 
 
484 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.56 
 
 
392 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  32.84 
 
 
490 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  32.58 
 
 
377 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  35.38 
 
 
525 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  32.53 
 
 
525 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  32.84 
 
 
476 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  33.84 
 
 
473 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  35.43 
 
 
462 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  30.18 
 
 
473 aa  116  3.9999999999999997e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.22 
 
 
524 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  30.63 
 
 
467 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  34.15 
 
 
495 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  34.75 
 
 
507 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  33.95 
 
 
594 aa  115  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  33.33 
 
 
418 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  35.98 
 
 
383 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  33.33 
 
 
503 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1716  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.8 
 
 
280 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.319195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  32.84 
 
 
391 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  34.14 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  31.79 
 
 
420 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  33.33 
 
 
476 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  34.15 
 
 
535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.07 
 
 
387 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  31.6 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  34.15 
 
 
483 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  32.39 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  32.85 
 
 
474 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  34.15 
 
 
495 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.26 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>