More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0798 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0798  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  100 
 
 
365 aa  709    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1464  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  61.19 
 
 
360 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3121  PDZ/DHR/GLGF domain protein  59.8 
 
 
359 aa  310  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7501  PDZ/DHR/GLGF domain protein  53.92 
 
 
364 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  56.03 
 
 
391 aa  266  5e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.657574  normal  0.225751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  52.12 
 
 
343 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.88 
 
 
614 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  43.3 
 
 
535 aa  186  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  37.06 
 
 
471 aa  185  9e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  37.23 
 
 
453 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  41.85 
 
 
423 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  39.03 
 
 
467 aa  177  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  38.91 
 
 
453 aa  177  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  40.72 
 
 
511 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  37.98 
 
 
468 aa  176  8e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  42.96 
 
 
443 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  42.01 
 
 
476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0250  heat shock protein  36.47 
 
 
481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0220  protease Do  36.47 
 
 
481 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.850727  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  41.4 
 
 
455 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3708  serine endoprotease  40.56 
 
 
455 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0987273  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3540  serine endoprotease  40.56 
 
 
451 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3539  serine endoprotease  40.56 
 
 
455 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0314705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3611  serine endoprotease  40.56 
 
 
455 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.26 
 
 
391 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  41.98 
 
 
395 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  38.26 
 
 
407 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  37.46 
 
 
407 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3646  serine endoprotease  40.21 
 
 
455 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.19 
 
 
523 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  38.77 
 
 
403 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.19 
 
 
518 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  43.26 
 
 
404 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6331  2-alkenal reductase  38.3 
 
 
372 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  33.15 
 
 
389 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.67 
 
 
524 aa  169  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3530  serine endoprotease  40.56 
 
 
455 aa  170  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00269541  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03094  serine endoprotease, periplasmic  40.21 
 
 
455 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  40.21 
 
 
455 aa  169  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  40.21 
 
 
455 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03045  hypothetical protein  40.21 
 
 
455 aa  169  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.471822  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3542  serine endoprotease  40.21 
 
 
455 aa  169  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3717  serine endoprotease  40.21 
 
 
455 aa  169  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000159943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3423  serine endoprotease  40.21 
 
 
455 aa  169  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000412048  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  41.26 
 
 
393 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4551  serine endoprotease  40.21 
 
 
455 aa  169  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00837947  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  38.78 
 
 
404 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  37.43 
 
 
374 aa  169  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  42.31 
 
 
511 aa  169  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  38.46 
 
 
380 aa  169  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  40.93 
 
 
442 aa  169  9e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  40.56 
 
 
402 aa  169  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  41.64 
 
 
449 aa  169  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  41.52 
 
 
413 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  40.07 
 
 
407 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.28 
 
 
442 aa  169  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  41.26 
 
 
401 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.26 
 
 
401 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  40.85 
 
 
456 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  40.06 
 
 
583 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  40.85 
 
 
455 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  39.45 
 
 
479 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  39.79 
 
 
474 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.89 
 
 
506 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  39.1 
 
 
492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  43.54 
 
 
465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  38.83 
 
 
489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  39.1 
 
 
477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  42.2 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  42.25 
 
 
491 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  40.83 
 
 
463 aa  167  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  42.81 
 
 
450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  40.56 
 
 
402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  38.7 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  40.83 
 
 
457 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  33.8 
 
 
459 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  40.83 
 
 
457 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  40.21 
 
 
388 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.7 
 
 
396 aa  167  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  42.81 
 
 
450 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.8 
 
 
408 aa  167  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  42.81 
 
 
450 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  41.05 
 
 
478 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.91 
 
 
401 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.62 
 
 
349 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  42.46 
 
 
450 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  39.72 
 
 
495 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  40.91 
 
 
401 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.91 
 
 
401 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.91 
 
 
401 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  40.07 
 
 
483 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  37.76 
 
 
459 aa  165  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  40.07 
 
 
483 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  40.07 
 
 
483 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  38.11 
 
 
462 aa  165  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  40.56 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  40.07 
 
 
495 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  39.44 
 
 
493 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  40.56 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  40.49 
 
 
455 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>