More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6331 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6331  2-alkenal reductase  100 
 
 
372 aa  726    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  69.49 
 
 
347 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  51.69 
 
 
338 aa  334  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0225  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  54.49 
 
 
365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  49.82 
 
 
361 aa  245  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0667  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.54 
 
 
376 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  43.79 
 
 
382 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  40.91 
 
 
408 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  41.13 
 
 
408 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  40.28 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  42.55 
 
 
402 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  43.21 
 
 
614 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.86 
 
 
428 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.71 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  36.49 
 
 
402 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  39.29 
 
 
402 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  37.86 
 
 
452 aa  195  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  39.29 
 
 
402 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  39.29 
 
 
402 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  39.29 
 
 
388 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  39.29 
 
 
402 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  42.12 
 
 
424 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  40.22 
 
 
398 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  38.93 
 
 
401 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.93 
 
 
401 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.29 
 
 
401 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.21 
 
 
415 aa  193  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  39.29 
 
 
401 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.29 
 
 
401 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  39.64 
 
 
404 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  39.29 
 
 
402 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.58 
 
 
398 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  42.03 
 
 
459 aa  192  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  38.93 
 
 
388 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  42.03 
 
 
459 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  38.43 
 
 
453 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  40.78 
 
 
396 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.57 
 
 
401 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  41.7 
 
 
391 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.18 
 
 
405 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  39.29 
 
 
404 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  38.93 
 
 
407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  39.29 
 
 
513 aa  189  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  38.57 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  38.93 
 
 
407 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  39.29 
 
 
403 aa  189  7e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  40.78 
 
 
491 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  39.45 
 
 
411 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  40.43 
 
 
385 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  40.28 
 
 
383 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  40.36 
 
 
451 aa  187  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.5 
 
 
401 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  40.21 
 
 
385 aa  186  7e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  40.36 
 
 
451 aa  186  8e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  37.5 
 
 
467 aa  186  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  37.86 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.5 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  41.13 
 
 
501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  39.72 
 
 
383 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  39.78 
 
 
386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.64 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  38.57 
 
 
402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  41.94 
 
 
504 aa  183  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  38.57 
 
 
386 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  38.93 
 
 
386 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1097  peptidase S1C, Do  35.83 
 
 
479 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.676957  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  40.62 
 
 
397 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  40.22 
 
 
487 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  36.42 
 
 
474 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.23 
 
 
396 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  36.11 
 
 
474 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  39.07 
 
 
386 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  38.19 
 
 
403 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  41.75 
 
 
406 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  39.27 
 
 
473 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  38.3 
 
 
386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  37.21 
 
 
477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  37.21 
 
 
477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  39.93 
 
 
520 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  37.77 
 
 
453 aa  179  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  38.35 
 
 
386 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  40.77 
 
 
375 aa  179  7e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  39.64 
 
 
493 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  39.72 
 
 
483 aa  179  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  39.64 
 
 
493 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  37.59 
 
 
392 aa  179  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  37.46 
 
 
456 aa  179  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  41.01 
 
 
503 aa  179  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  39.64 
 
 
493 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  37.99 
 
 
449 aa  179  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  38.35 
 
 
473 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  38.65 
 
 
483 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  39.64 
 
 
494 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  38.21 
 
 
455 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  33.78 
 
 
380 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.7 
 
 
387 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  40.51 
 
 
423 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0472  protease Do  37.77 
 
 
455 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00978488  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  38.77 
 
 
402 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0472  serine endoprotease  37.77 
 
 
455 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0649674  normal  0.0819783 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>