More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4674 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4674  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 423 aa  797    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10126  serine protease pepA  44.79 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.16358e-29  normal  0.942677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5280  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.37 
 
 		 341 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4912  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.04 
 
 		 341 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.899758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5001  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.04 
 
 		 341 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.53 
 
 		 487 aa  181  2e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1278  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  37.58 
 
 		 297 aa  176  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5537  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.94 
 
 		 335 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  39.14 
 
 		 539 aa  160  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  35.62 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  40 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15600  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  34.85 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0395297  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  38.25 
 
 		 443 aa  150  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.74 
 
 		 569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4679  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.38 
 
 		 440 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0383364 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.83 
 
 		 392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4299  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.38 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4385  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.38 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.63 
 
 		 486 aa  146  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  34.92 
 
 		 393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  34.32 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0703  2-alkenal reductase  33.77 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.71 
 
 		 392 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0358901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.02 
 
 		 579 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3830  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.62 
 
 		 515 aa  143  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778945  normal  0.0341938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0798  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.02 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  37.95 
 
 		 575 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  36.69 
 
 		 385 aa  140  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.21 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  38.3 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  35.35 
 
 		 459 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3273  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  37.94 
 
 		 485 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  34.01 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  35.02 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  34.88 
 
 		 495 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.31 
 
 		 674 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.03 
 
 		 375 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  33.23 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  34.24 
 
 		 477 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  34.24 
 
 		 477 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4842  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.38 
 
 		 456 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  33.79 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  36.45 
 
 		 385 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0667  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.75 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.63 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.88 
 
 		 512 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4062  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.88 
 
 		 524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  35.05 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  35 
 
 		 494 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  35.78 
 
 		 673 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  32 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  35.05 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3684  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.12 
 
 		 518 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.358044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  34.67 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1889  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.62 
 
 		 515 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.271087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.74 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.79 
 
 		 384 aa  133  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  36.82 
 
 		 584 aa  133  6e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  38.21 
 
 		 412 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11001  serine protease pepD  36.45 
 
 		 464 aa  133  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000053367  normal  0.424973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  35.45 
 
 		 508 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  34.33 
 
 		 493 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  34.33 
 
 		 493 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  34.78 
 
 		 475 aa  132  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  33.89 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  35.05 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  33.89 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  33.89 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  33.89 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  33.89 
 
 		 495 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  33.89 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  34.33 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  35.18 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  35.18 
 
 		 408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  33.89 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  34.95 
 
 		 577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  35.98 
 
 		 594 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  35.36 
 
 		 489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  34 
 
 		 494 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  36.39 
 
 		 485 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  34 
 
 		 494 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.67 
 
 		 640 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  35.08 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  34.02 
 
 		 504 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  34.69 
 
 		 524 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  31.99 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.79 
 
 		 366 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  34.74 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1716  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.31 
 
 		 280 aa  130  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.319195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  33.88 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1464  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  34.56 
 
 		 360 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal  0.881007 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  33.45 
 
 		 501 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  29.78 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  33.1 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  33.9 
 
 		 491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  32.46 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  33.77 
 
 		 505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.79 
 
 		 545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  33.33 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  36.3 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>