More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0667 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0667  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
376 aa  725    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  64.33 
 
 
361 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4430  PDZ/DHR/GLGF domain protein  49.32 
 
 
338 aa  258  9e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  48.68 
 
 
347 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0225  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  46.93 
 
 
365 aa  249  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6331  2-alkenal reductase  47.54 
 
 
372 aa  242  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  42.28 
 
 
396 aa  231  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  38.11 
 
 
452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  37.76 
 
 
459 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  42.96 
 
 
513 aa  218  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  37.76 
 
 
459 aa  218  2e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.28 
 
 
398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  45.7 
 
 
385 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  41.22 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  45.45 
 
 
504 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  42.03 
 
 
489 aa  212  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.6 
 
 
472 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  39.58 
 
 
473 aa  212  1e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.96 
 
 
398 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.42 
 
 
408 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  42.66 
 
 
393 aa  210  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  43.58 
 
 
491 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  36.2 
 
 
415 aa  209  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  41.64 
 
 
488 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  37.85 
 
 
398 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  40.06 
 
 
511 aa  209  8e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  39.18 
 
 
376 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  38.89 
 
 
376 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  33.24 
 
 
467 aa  208  1e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.79 
 
 
415 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  38.46 
 
 
383 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  39.19 
 
 
408 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  41.3 
 
 
404 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  44.09 
 
 
520 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  38.41 
 
 
404 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  39.47 
 
 
396 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.69 
 
 
478 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  39.19 
 
 
408 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  41.43 
 
 
487 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10940  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  36.89 
 
 
539 aa  206  6e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000345024  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  39.93 
 
 
451 aa  206  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  43.68 
 
 
509 aa  206  8e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  40.83 
 
 
489 aa  205  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  38.39 
 
 
456 aa  205  9e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1904  HtrA2 peptidase  40.06 
 
 
423 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  0.334422 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  36.59 
 
 
453 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  38.23 
 
 
403 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  38.85 
 
 
477 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  38.85 
 
 
477 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.53 
 
 
401 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  41.14 
 
 
412 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  43.57 
 
 
514 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.4 
 
 
386 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.53 
 
 
401 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  34.53 
 
 
401 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.53 
 
 
401 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  34.27 
 
 
401 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.27 
 
 
401 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  36.7 
 
 
402 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  37.27 
 
 
493 aa  203  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  39.45 
 
 
511 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  40.22 
 
 
407 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  41.28 
 
 
478 aa  202  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  39.31 
 
 
386 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  38.78 
 
 
407 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  38.64 
 
 
387 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.36 
 
 
379 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  39.93 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  43.06 
 
 
476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  36.95 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  42.91 
 
 
503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.33 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.12 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  34.02 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  39.86 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  34.02 
 
 
402 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.4 
 
 
486 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  38.64 
 
 
388 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  41.75 
 
 
385 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  39.93 
 
 
450 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  39.93 
 
 
450 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  39.49 
 
 
484 aa  200  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  37.43 
 
 
368 aa  200  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  39.78 
 
 
474 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  38.87 
 
 
449 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  43.01 
 
 
413 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  39.64 
 
 
474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  38.64 
 
 
388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  34.02 
 
 
402 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  40.19 
 
 
375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  34.02 
 
 
402 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  39.6 
 
 
450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  34.02 
 
 
402 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  38.68 
 
 
411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  39.6 
 
 
450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  39.6 
 
 
450 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  42.71 
 
 
490 aa  199  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.03 
 
 
405 aa  199  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  36.5 
 
 
500 aa  199  6e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  39.2 
 
 
450 aa  199  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>