More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0120 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  100 
 
 		 392 aa  787    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  72.63 
 
 		 392 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  55 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  51.17 
 
 		 399 aa  388  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  47.92 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  45.03 
 
 		 393 aa  342  9e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.84 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.17 
 
 		 393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.04 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.79 
 
 		 392 aa  319  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  43.65 
 
 		 397 aa  291  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  41.48 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  49.21 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.96 
 
 		 397 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  41.8 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.74 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  37.9 
 
 		 395 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  37.9 
 
 		 395 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  37.9 
 
 		 395 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.45 
 
 		 402 aa  239  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  40.15 
 
 		 395 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  36.9 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  37.15 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  37.94 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  38.27 
 
 		 399 aa  216  4e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  37.78 
 
 		 397 aa  202  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  33.77 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.89 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  33.95 
 
 		 398 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  34.27 
 
 		 383 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  30.07 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.57 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  34.97 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2917  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.86 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  36.71 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.47 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  32.99 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.18 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0422  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.19 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  36.6 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.79 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.39 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0507  trypsin-like serine protease  34.63 
 
 		 489 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  35.26 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1064  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.03 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  35.1 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  35.1 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1719  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.26 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000748788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.53 
 
 		 288 aa  66.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.473362  hitchhiker  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.11 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1808  trypsin-like serine protease  32.26 
 
 		 285 aa  66.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000335064  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  30.86 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  30.94 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.12 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.18 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.09 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  30.18 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  31.77 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  30.05 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  30.05 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  35.06 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  32.16 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  30.05 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  27.49 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3599  periplasmic serine protease DegS  29.78 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2439  trypsin-like serine protease  28.78 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  30.05 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1248  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.53 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.490271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.95 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0037  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.68 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2668  exported serine protease  27.01 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00113896  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  34.67 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.5 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3363  periplasmic serine protease DegS  33.79 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120953  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  31.55 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0500  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.1 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  30.13 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  30.29 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  33.73 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  32.41 
 
 		 500 aa  63.2  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.03 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  28.9 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.14 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  34.19 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  29.25 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  30.43 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  32.92 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.43 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  29.65 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  34.42 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  30.91 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  30.65 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  31.97 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  29.19 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  27.88 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0689  DegS serine peptidase  29.19 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  hitchhiker  0.000493421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0741  periplasmic serine protease DegS  29.19 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.905633  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08291  trypsin-like serine protease  31.82 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  33.12 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>