More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1376 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  100 
 
 
397 aa  775    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  87.91 
 
 
397 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  77.22 
 
 
395 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  77.47 
 
 
395 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  77.47 
 
 
395 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  62.47 
 
 
397 aa  426  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  48.11 
 
 
399 aa  315  7e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  46.7 
 
 
395 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  44.75 
 
 
401 aa  303  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.35 
 
 
392 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  44.5 
 
 
394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.1 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.82 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  41.65 
 
 
393 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.33 
 
 
393 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  38.67 
 
 
393 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.08 
 
 
395 aa  238  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  36.14 
 
 
392 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  38.83 
 
 
397 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.88 
 
 
392 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  36.51 
 
 
394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  37.67 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  37.43 
 
 
402 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  42.42 
 
 
394 aa  209  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.81 
 
 
402 aa  196  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  33.33 
 
 
394 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.41 
 
 
391 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.06 
 
 
394 aa  162  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  34.08 
 
 
398 aa  159  7e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.08 
 
 
389 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  33.26 
 
 
432 aa  152  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  33.25 
 
 
383 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  29.21 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  36.17 
 
 
484 aa  69.7  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  34.97 
 
 
480 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  32.2 
 
 
424 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  37.93 
 
 
514 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  32.02 
 
 
391 aa  66.2  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  34.44 
 
 
488 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  34.27 
 
 
385 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  32.62 
 
 
351 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  30.46 
 
 
442 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  35.57 
 
 
500 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  34.48 
 
 
494 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.82 
 
 
423 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  26.09 
 
 
460 aa  63.9  0.000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.03 
 
 
410 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  35.21 
 
 
495 aa  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  31.49 
 
 
411 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  31.03 
 
 
411 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  32.6 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  29.79 
 
 
467 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  34.42 
 
 
415 aa  62.4  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  31.91 
 
 
485 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.15 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  32.6 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  31.49 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  30.46 
 
 
459 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0739  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.85 
 
 
371 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.05 
 
 
358 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  35.17 
 
 
493 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.88 
 
 
363 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  34.48 
 
 
494 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  32.2 
 
 
518 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  34.81 
 
 
516 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  31.58 
 
 
594 aa  61.2  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4948  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.52 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809867  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  31.91 
 
 
485 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  35.17 
 
 
493 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  35.17 
 
 
493 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  32.17 
 
 
537 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.46 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  33.56 
 
 
480 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  33.56 
 
 
504 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  31.72 
 
 
513 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  34.48 
 
 
491 aa  60.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  34.97 
 
 
516 aa  60.5  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.72 
 
 
399 aa  60.1  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  26.25 
 
 
446 aa  60.1  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  33.56 
 
 
503 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  34.48 
 
 
494 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  34.72 
 
 
497 aa  59.7  0.00000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  34.48 
 
 
494 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  31.15 
 
 
375 aa  59.7  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  27.87 
 
 
456 aa  59.7  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  33.57 
 
 
469 aa  59.7  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  30.72 
 
 
453 aa  59.7  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  34.04 
 
 
489 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  31.07 
 
 
418 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5277  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic contain C-terminal PDZ domain-like protein  27.92 
 
 
425 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  27.78 
 
 
461 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  33.1 
 
 
483 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.49 
 
 
362 aa  59.3  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  31.1 
 
 
515 aa  59.7  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  34.01 
 
 
464 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1619  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.06 
 
 
242 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.527174 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  33.1 
 
 
483 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3642  protease Do  26.78 
 
 
456 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.393796  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  33.1 
 
 
483 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.7 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>