More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4899 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  99.75 
 
 
395 aa  769    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  100 
 
 
395 aa  770    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  100 
 
 
395 aa  770    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  77.47 
 
 
397 aa  598  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  76.71 
 
 
397 aa  585  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  69.27 
 
 
397 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  48.36 
 
 
401 aa  329  6e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  47.97 
 
 
395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  48.61 
 
 
399 aa  318  9e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  47.83 
 
 
394 aa  302  9e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.27 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.37 
 
 
397 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.09 
 
 
392 aa  279  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  42.67 
 
 
393 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.58 
 
 
393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  39.58 
 
 
393 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  40.54 
 
 
397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  37.5 
 
 
392 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.53 
 
 
392 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.08 
 
 
395 aa  229  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  38.9 
 
 
399 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  36.98 
 
 
394 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  39.06 
 
 
402 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  43.62 
 
 
394 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.35 
 
 
402 aa  203  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  33.86 
 
 
394 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.96 
 
 
394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.24 
 
 
391 aa  169  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  33.9 
 
 
398 aa  161  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.06 
 
 
389 aa  156  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  34.1 
 
 
383 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  31.64 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  33.33 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  28.97 
 
 
484 aa  70.9  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  36.05 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.64 
 
 
426 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  30.94 
 
 
442 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  34.48 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  31.89 
 
 
474 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  30.69 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  30.69 
 
 
480 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  32.04 
 
 
506 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.72 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  32.04 
 
 
493 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  30.11 
 
 
472 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  33.33 
 
 
480 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  32.09 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  30.94 
 
 
459 aa  64.3  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  32.5 
 
 
420 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22490  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  30.64 
 
 
247 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0306  HtrA2 peptidase  32.72 
 
 
401 aa  63.5  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00230132  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1278  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.06 
 
 
297 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.732427  normal  0.339294 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.01 
 
 
450 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0029  serine protease  25.65 
 
 
460 aa  63.2  0.000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 
363 aa  62.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  30.65 
 
 
476 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  31.4 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  32.9 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  31.4 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  31.41 
 
 
493 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  29.03 
 
 
471 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  31.52 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  33.33 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  30.73 
 
 
391 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.72 
 
 
358 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  29.62 
 
 
418 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  28.81 
 
 
369 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  32.28 
 
 
453 aa  60.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  28.49 
 
 
478 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  33.17 
 
 
499 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.87 
 
 
405 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  31.21 
 
 
432 aa  60.5  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  36.62 
 
 
514 aa  60.5  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  28.35 
 
 
476 aa  60.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.81 
 
 
399 aa  60.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1904  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.97 
 
 
416 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0620222  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  28.48 
 
 
525 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  30.1 
 
 
473 aa  60.5  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5277  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic contain C-terminal PDZ domain-like protein  29.22 
 
 
425 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274664 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  29.26 
 
 
388 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  31.91 
 
 
485 aa  60.1  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.18 
 
 
387 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  29.57 
 
 
476 aa  59.7  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.37 
 
 
415 aa  59.7  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  33.57 
 
 
490 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  34.27 
 
 
488 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.14 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  31.43 
 
 
411 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.65 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.18 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_907  serine protease, DegP/HtrA family  34.67 
 
 
377 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000696598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1578  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.82 
 
 
480 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.5845  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  32.65 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  32.48 
 
 
497 aa  58.5  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  32.19 
 
 
467 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  29.03 
 
 
476 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.72 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  28.78 
 
 
464 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  34.74 
 
 
516 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>