More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0472 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  806    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  63.28 
 
 
394 aa  489  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  51.28 
 
 
392 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  53.28 
 
 
402 aa  381  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.21 
 
 
392 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.12 
 
 
393 aa  315  7e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  44.79 
 
 
393 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.89 
 
 
392 aa  305  7e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.18 
 
 
392 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.58 
 
 
395 aa  279  7e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.1 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  39.69 
 
 
393 aa  273  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  44.76 
 
 
394 aa  272  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  39.39 
 
 
397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  39.25 
 
 
399 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  39.75 
 
 
395 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.68 
 
 
391 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  38.27 
 
 
395 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  38.27 
 
 
395 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  38.27 
 
 
395 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  39.05 
 
 
394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  38.04 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  37.14 
 
 
397 aa  233  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  37.66 
 
 
401 aa  230  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.41 
 
 
402 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  36.7 
 
 
397 aa  192  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  29.09 
 
 
394 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  32.47 
 
 
398 aa  159  7e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.31 
 
 
394 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  29.89 
 
 
383 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.17 
 
 
389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  30.05 
 
 
432 aa  99.4  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  33.14 
 
 
493 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  32.56 
 
 
506 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  32.56 
 
 
493 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  33.1 
 
 
537 aa  66.2  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2398  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
531 aa  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.9 
 
 
375 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  31.11 
 
 
501 aa  65.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  31.52 
 
 
499 aa  64.3  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  32.19 
 
 
497 aa  63.9  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  35.26 
 
 
495 aa  63.2  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0798  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.73 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  30.25 
 
 
382 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  31.33 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  31.33 
 
 
402 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.56 
 
 
358 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  28.02 
 
 
474 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  28.92 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  30.51 
 
 
502 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  27.63 
 
 
474 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  30 
 
 
424 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.55 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1064  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.66 
 
 
321 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235615  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  27.94 
 
 
469 aa  60.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.36 
 
 
381 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  26.82 
 
 
481 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  30.54 
 
 
420 aa  59.7  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.33 
 
 
401 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  30.52 
 
 
514 aa  59.7  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  24.38 
 
 
476 aa  59.7  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0739  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.24 
 
 
371 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  33.56 
 
 
473 aa  58.9  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.01 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  30.77 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  33.79 
 
 
373 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.18 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  32.21 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  28.29 
 
 
473 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  33.8 
 
 
527 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  33.79 
 
 
357 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  26.05 
 
 
479 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  28.7 
 
 
477 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  33.1 
 
 
523 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  33.97 
 
 
471 aa  58.2  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  32.87 
 
 
487 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  33.97 
 
 
471 aa  57.8  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  33.1 
 
 
528 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  30.3 
 
 
459 aa  57.4  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1244  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.5 
 
 
330 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  28.77 
 
 
512 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  28.93 
 
 
480 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  32.68 
 
 
351 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  27.91 
 
 
473 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.14 
 
 
283 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  33.1 
 
 
373 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  32.1 
 
 
516 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0422  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.04 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  28.26 
 
 
477 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  32.05 
 
 
464 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  36 
 
 
502 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  31.91 
 
 
492 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  31.91 
 
 
492 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  33.8 
 
 
520 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  26.54 
 
 
479 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  29.09 
 
 
442 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  33.11 
 
 
503 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.94 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  32.62 
 
 
493 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.9 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>