More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1064 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1064  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
321 aa  619  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235615  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3244  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  56.53 
 
 
321 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3890  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  57.14 
 
 
317 aa  333  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1244  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.83 
 
 
330 aa  322  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2314  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  56.23 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4479  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.35 
 
 
307 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.8 
 
 
372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.49 
 
 
366 aa  136  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  44.85 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  45.45 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  42.72 
 
 
446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  45.03 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  41.58 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  43.85 
 
 
500 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  47.02 
 
 
501 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  46.51 
 
 
451 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  40.43 
 
 
453 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  46.15 
 
 
516 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  41.45 
 
 
469 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  45.4 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  45.4 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  46.51 
 
 
450 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  44.85 
 
 
455 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  45.4 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  45.4 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  45.4 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  45.4 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  45.4 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  41.29 
 
 
614 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  43.86 
 
 
444 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  45.4 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  44.44 
 
 
453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1021  trypsin-like serine protease  34.82 
 
 
381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.75122  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0580  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.89 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  48.5 
 
 
476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  46.51 
 
 
450 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  46.51 
 
 
450 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  45.93 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  46.51 
 
 
450 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  43.5 
 
 
458 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18911  trypsin-like serine protease  34.82 
 
 
381 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.58243  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  37.73 
 
 
383 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  45.45 
 
 
463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  44.38 
 
 
375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  45.45 
 
 
457 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  45.45 
 
 
457 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  45.93 
 
 
450 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  45.93 
 
 
450 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  45.93 
 
 
450 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.26 
 
 
398 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  45.93 
 
 
450 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  46.29 
 
 
465 aa  129  6e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  45.45 
 
 
449 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  38.67 
 
 
455 aa  129  8.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  43.1 
 
 
374 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  42.47 
 
 
524 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  45.4 
 
 
475 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  45.4 
 
 
478 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  40.88 
 
 
459 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  42.47 
 
 
524 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  45.4 
 
 
478 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  43.26 
 
 
404 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  44.77 
 
 
450 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  44.44 
 
 
383 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  45.4 
 
 
475 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  46.01 
 
 
511 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  43.26 
 
 
404 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  45.4 
 
 
475 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32730  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  41.46 
 
 
443 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229019  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  44.85 
 
 
456 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  45.4 
 
 
511 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  43.27 
 
 
483 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  45.4 
 
 
511 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  43.27 
 
 
384 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  44.91 
 
 
462 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  45.4 
 
 
496 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  44.24 
 
 
513 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.22 
 
 
640 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  43.5 
 
 
362 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  42.7 
 
 
398 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  43.65 
 
 
520 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0600  PDZ/DHR/GLGF  42.94 
 
 
353 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  43.86 
 
 
383 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  42.01 
 
 
264 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  43.2 
 
 
481 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  43.41 
 
 
456 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  43.2 
 
 
481 aa  127  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  43.2 
 
 
481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  42.53 
 
 
400 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  48.15 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.86 
 
 
379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  44.17 
 
 
474 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  43.86 
 
 
383 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  44.97 
 
 
495 aa  126  5e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  44 
 
 
460 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  41.38 
 
 
452 aa  126  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  44.24 
 
 
456 aa  126  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.86 
 
 
384 aa  126  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  43.86 
 
 
379 aa  125  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.77 
 
 
474 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>