More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0798 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0798  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
296 aa  571  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1229  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  79.09 
 
 
298 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0581563  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  40.71 
 
 
348 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  37.69 
 
 
505 aa  150  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2445  PDZ/DHR/GLGF domain protein  41.41 
 
 
282 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  37.31 
 
 
503 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  37.31 
 
 
503 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2309  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.15 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00460586  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  37.92 
 
 
476 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  37.92 
 
 
490 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  36.53 
 
 
474 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  36.69 
 
 
492 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.33 
 
 
351 aa  146  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  36.01 
 
 
487 aa  145  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  39.27 
 
 
493 aa  145  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  36.94 
 
 
498 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  36.8 
 
 
493 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  36.47 
 
 
469 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  39.48 
 
 
514 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  39.48 
 
 
514 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  37 
 
 
514 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  36.8 
 
 
501 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  37.25 
 
 
498 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4054  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.83 
 
 
364 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.779263  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  36.63 
 
 
496 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  34.31 
 
 
468 aa  142  9e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  31.99 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  31.72 
 
 
472 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  34.44 
 
 
505 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  38.87 
 
 
488 aa  141  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.87 
 
 
474 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  38.29 
 
 
516 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  38.87 
 
 
474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  35.04 
 
 
494 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  37.6 
 
 
487 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  35.38 
 
 
485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  35.04 
 
 
487 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  37.55 
 
 
462 aa  139  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  36.8 
 
 
509 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  35.93 
 
 
464 aa  139  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  35.82 
 
 
466 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  34.96 
 
 
478 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  35.04 
 
 
488 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  35.48 
 
 
391 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  35.91 
 
 
464 aa  138  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2753  serine protease DO-like precursor  38.52 
 
 
345 aa  138  8.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.88 
 
 
415 aa  137  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  35.36 
 
 
511 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.62 
 
 
316 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  30.27 
 
 
471 aa  137  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  35.63 
 
 
485 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3861  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.56 
 
 
317 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  36.3 
 
 
458 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  35.47 
 
 
503 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4090  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.92 
 
 
291 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153565  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  32 
 
 
467 aa  136  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  32.84 
 
 
411 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  35.71 
 
 
461 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  35.71 
 
 
502 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  35.71 
 
 
502 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  35.71 
 
 
485 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  36.33 
 
 
480 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0885  PDZ/DHR/GLGF  34.88 
 
 
375 aa  135  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  35.71 
 
 
502 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  32.97 
 
 
408 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  35.71 
 
 
502 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  35.71 
 
 
502 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1900  peptidase S1C, Do  35.16 
 
 
489 aa  135  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2227  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.85 
 
 
312 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.247792  hitchhiker  0.0000126621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  36.04 
 
 
473 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  35.77 
 
 
467 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  36.06 
 
 
491 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  34.43 
 
 
505 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  34.89 
 
 
489 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  35.27 
 
 
385 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  35.71 
 
 
485 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  35.8 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  33.46 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  34.71 
 
 
351 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  38.15 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  35.93 
 
 
473 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  32.37 
 
 
415 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  34.55 
 
 
500 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  32.71 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0953  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.45 
 
 
339 aa  133  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00207331 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  36.46 
 
 
528 aa  133  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  33.58 
 
 
488 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  33.89 
 
 
467 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  34.43 
 
 
507 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  34.07 
 
 
502 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  33.58 
 
 
488 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  34.55 
 
 
499 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  32.61 
 
 
453 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  34.55 
 
 
499 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  35.64 
 
 
479 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  34.32 
 
 
477 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  34.32 
 
 
477 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  31.8 
 
 
467 aa  132  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  30.77 
 
 
471 aa  132  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  34.75 
 
 
492 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>